18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6548 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6548  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5568  NERD domain-containing protein  60.79 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.539565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3742  hypothetical protein  42.35 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281003  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  31.47 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  26.05 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  25.41 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  26.75 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  24.19 
 
 		 353 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  24.03 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  27.45 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  36.23 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  25.97 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  30.61 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  26.32 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  26.17 
 
 		 267 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  36.47 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  27.61 
 
 		 259 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>