95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0649 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 267 aa  558  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  60.98 
 
 		 262 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  55.39 
 
 		 269 aa  321  9.000000000000001e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  54.02 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  54.28 
 
 		 267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  51.75 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  57.3 
 
 		 199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  45.78 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  41.59 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  47.09 
 
 		 355 aa  185  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  47.85 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  41.6 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  46.45 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  41.38 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  38.03 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  33.08 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  34.02 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  34.25 
 
 		 387 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  33.67 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  34.78 
 
 		 353 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  36.82 
 
 		 212 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  33.86 
 
 		 212 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  33.86 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  33.86 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07440  hypothetical protein  51.11 
 
 		 111 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316107  normal  0.202998 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  29.08 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  30 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1889  hypothetical protein  31.58 
 
 		 139 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.344159 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  28.49 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  29.45 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  25.42 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  27.18 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  58.7 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  44.62 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  39.74 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  44.59 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  49.06 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  50.98 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  38.55 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  45.76 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  40 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  35.35 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  48.89 
 
 		 739 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  45.1 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  49.06 
 
 		 313 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  34 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3513  NERD domain-containing protein  30.7 
 
 		 226 aa  52.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  55.56 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  30.4 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  52.78 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  45.95 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 798 aa  49.7  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  48.72 
 
 		 730 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  43.64 
 
 		 804 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  41.54 
 
 		 798 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  41.86 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  52.5 
 
 		 744 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4796  NERD domain-containing protein  31.53 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  32.95 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  45.45 
 
 		 710 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  36.51 
 
 		 704 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  48.48 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  27.1 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  39.29 
 
 		 702 aa  46.2  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 694 aa  45.8  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  41.46 
 
 		 671 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  41.46 
 
 		 671 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  30.68 
 
 		 863 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  54.55 
 
 		 708 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  39.66 
 
 		 799 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6548  NERD domain-containing protein  27.45 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  38.81 
 
 		 798 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3660  NERD domain-containing protein  23.91 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  43.18 
 
 		 669 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  38.78 
 
 		 694 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  33.78 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  37.93 
 
 		 798 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  36.73 
 
 		 689 aa  43.5  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  32.04 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  38.6 
 
 		 802 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  29.9 
 
 		 711 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  43.9 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 844 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0711  NERD domain-containing protein  28.26 
 
 		 185 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0218  NERD domain protein  27 
 
 		 310 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  40.54 
 
 		 743 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  36.96 
 
 		 813 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  39.02 
 
 		 671 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  39.53 
 
 		 697 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  57.14 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  57.14 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  43.59 
 
 		 666 aa  42  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  45.45 
 
 		 747 aa  42  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  43.24 
 
 		 765 aa  42  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3449  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  41.67 
 
 		 249 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>