250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1118 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  36.82 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  40 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  35.41 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  36.61 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  32.68 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  33.46 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  31.2 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  32.07 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  39.56 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  46.15 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  39.53 
 
 		 212 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  39.53 
 
 		 212 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  32.77 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  35.15 
 
 		 329 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  39.35 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  43.24 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  38.15 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  36.26 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  32.51 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  30.73 
 
 		 207 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  31.72 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  25.25 
 
 		 387 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  31.85 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  28.88 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  68.97 
 
 		 702 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  27.43 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07440  hypothetical protein  39.76 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316107  normal  0.202998 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  65.52 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 817 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  28 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  42.31 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  57.5 
 
 		 704 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  28.24 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  36.36 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  42.37 
 
 		 814 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0008  DNA topoisomerase I-related protein  48.21 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  45.1 
 
 		 814 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  42.37 
 
 		 812 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  26.2 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  27.94 
 
 		 836 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  62.07 
 
 		 695 aa  53.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  37.74 
 
 		 765 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3513  NERD domain-containing protein  25 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  54.05 
 
 		 700 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  53.66 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  54.05 
 
 		 700 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  21.96 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  41.67 
 
 		 323 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  52.5 
 
 		 853 aa  52  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  35.85 
 
 		 765 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  41.67 
 
 		 323 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  40.38 
 
 		 768 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  48 
 
 		 762 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  55.17 
 
 		 700 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  41.54 
 
 		 684 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  24.1 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  38.71 
 
 		 759 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  38.71 
 
 		 759 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  56.67 
 
 		 743 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3742  hypothetical protein  29.09 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  39.34 
 
 		 694 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  56.67 
 
 		 708 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  61.29 
 
 		 896 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  61.29 
 
 		 849 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2469  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  51.35 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  66.67 
 
 		 747 aa  49.7  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002062  Zn-finger domain-containing protein  54.29 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3579  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  53.12 
 
 		 180 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0127763  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3766  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  53.12 
 
 		 180 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000848781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  43.14 
 
 		 711 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  37.68 
 
 		 936 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0442  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  53.12 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  63.33 
 
 		 977 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  60 
 
 		 922 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  56.67 
 
 		 845 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  36.51 
 
 		 793 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  52.5 
 
 		 715 aa  49.3  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  47.22 
 
 		 865 aa  48.9  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  31.73 
 
 		 901 aa  48.9  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0359  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  50 
 
 		 185 aa  48.9  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0044685  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  25.81 
 
 		 798 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  53.12 
 
 		 1041 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  55.88 
 
 		 836 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  58.06 
 
 		 849 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  57.89 
 
 		 700 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  57.89 
 
 		 700 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  29.2 
 
 		 676 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  56.67 
 
 		 916 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  58.62 
 
 		 798 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  26.01 
 
 		 931 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00387  DNA topoisomerase A  51.43 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf298  DNA topoisomerase I  58.06 
 
 		 620 aa  48.1  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.504202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  36.76 
 
 		 911 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03085  hypothetical protein  60 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  42.11 
 
 		 779 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  46.15 
 
 		 851 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  57.14 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  53.33 
 
 		 911 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>