More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf298 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf298  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 620 aa  1272    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.504202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  38.79 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  36.26 
 
 		 700 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  35.79 
 
 		 711 aa  364  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  37.24 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  37.22 
 
 		 696 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  36.42 
 
 		 700 aa  363  6e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  37.36 
 
 		 693 aa  363  6e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  35.93 
 
 		 700 aa  362  1e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  35.68 
 
 		 695 aa  359  8e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  36.81 
 
 		 689 aa  359  9e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  38.2 
 
 		 706 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  37.22 
 
 		 708 aa  356  7.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  37.34 
 
 		 714 aa  353  4e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  37.98 
 
 		 691 aa  353  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  35.61 
 
 		 691 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  35.61 
 
 		 691 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  35.32 
 
 		 710 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  35.45 
 
 		 704 aa  350  3e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  36.09 
 
 		 703 aa  350  4e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  35.53 
 
 		 703 aa  349  8e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  34.73 
 
 		 697 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  36.16 
 
 		 706 aa  349  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  36.88 
 
 		 706 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  35.62 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  35.84 
 
 		 703 aa  347  4e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  35.29 
 
 		 694 aa  346  8.999999999999999e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  35.11 
 
 		 702 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  35.79 
 
 		 693 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  34.87 
 
 		 702 aa  345  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  36.55 
 
 		 692 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  35.43 
 
 		 686 aa  343  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  37.92 
 
 		 691 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  35.05 
 
 		 697 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  34.31 
 
 		 695 aa  341  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  36.28 
 
 		 692 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  35.96 
 
 		 692 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  35.96 
 
 		 692 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  36.12 
 
 		 692 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  35.96 
 
 		 692 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  35.96 
 
 		 692 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  36.28 
 
 		 692 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  35.79 
 
 		 692 aa  340  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  36.82 
 
 		 693 aa  340  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  35.96 
 
 		 692 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  36.39 
 
 		 692 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  35.37 
 
 		 690 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  35.94 
 
 		 684 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  34.84 
 
 		 689 aa  336  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  34.74 
 
 		 708 aa  335  1e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  34.52 
 
 		 696 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  34.85 
 
 		 694 aa  335  1e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  37.07 
 
 		 633 aa  334  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  33.64 
 
 		 700 aa  333  7.000000000000001e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  38.39 
 
 		 633 aa  332  9e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  34.09 
 
 		 700 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  34.17 
 
 		 711 aa  330  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  33.49 
 
 		 836 aa  330  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  34.78 
 
 		 715 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  35.33 
 
 		 696 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  32.87 
 
 		 836 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  32.96 
 
 		 859 aa  325  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  33.02 
 
 		 851 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  34.02 
 
 		 758 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  33.02 
 
 		 851 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  34.13 
 
 		 751 aa  323  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  36.22 
 
 		 721 aa  323  8e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  33.44 
 
 		 865 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  33.44 
 
 		 865 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  33.44 
 
 		 865 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  34.08 
 
 		 746 aa  320  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  33.44 
 
 		 865 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  33.44 
 
 		 865 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  34.4 
 
 		 758 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  32.98 
 
 		 813 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  32.97 
 
 		 793 aa  318  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  33.02 
 
 		 865 aa  316  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  33.02 
 
 		 865 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  33.02 
 
 		 865 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  33.02 
 
 		 865 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  33.02 
 
 		 865 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  33.02 
 
 		 865 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  33.02 
 
 		 865 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  33.02 
 
 		 865 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  33.39 
 
 		 868 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  33.02 
 
 		 865 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  33.66 
 
 		 743 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  33.39 
 
 		 868 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 		 760 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  30.82 
 
 		 831 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  33.85 
 
 		 780 aa  313  6.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  33.79 
 
 		 879 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  32.86 
 
 		 841 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 831 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  30.35 
 
 		 831 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1783  DNA topoisomerase I  33.59 
 
 		 903 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  32.14 
 
 		 789 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  32.55 
 
 		 868 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0695  DNA topoisomerase I  34.42 
 
 		 678 aa  311  2e-83  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  33.07 
 
 		 767 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>