65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1615 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  692    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  84.02 
 
 		 338 aa  577  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  46.07 
 
 		 230 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  49.17 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  47.83 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  44.21 
 
 		 228 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  45.33 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  40.93 
 
 		 269 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  44.32 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  42.69 
 
 		 199 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  41.71 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  38.67 
 
 		 207 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  35.35 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  41.36 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  31.12 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  40.12 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  39.51 
 
 		 212 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  39.51 
 
 		 212 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  39.51 
 
 		 212 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  37.5 
 
 		 259 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  38.04 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  37.76 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  40.3 
 
 		 353 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  32.21 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1889  hypothetical protein  41.49 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.344159 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  28.86 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  29.59 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  58.33 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  51.22 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  31.96 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  44.3 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  55.56 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  50 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07440  hypothetical protein  44.07 
 
 		 111 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316107  normal  0.202998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  52.78 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  51.35 
 
 		 154 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  47.5 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  44.74 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  48.65 
 
 		 739 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  46.15 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  51.28 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  47.5 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  51.35 
 
 		 230 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  47.37 
 
 		 254 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  56.76 
 
 		 255 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  45.95 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0711  NERD domain-containing protein  30.3 
 
 		 185 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  48.65 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  47.06 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0336  hypothetical protein  33.04 
 
 		 234 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  41.46 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  48.65 
 
 		 689 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5568  NERD domain-containing protein  33.85 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.539565 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3513  NERD domain-containing protein  32.61 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  39.47 
 
 		 744 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 686 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  28.85 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 669 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  43.24 
 
 		 704 aa  43.5  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  42.42 
 
 		 260 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  33.03 
 
 		 212 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  32.93 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>