20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0336 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0336  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3845  NERD domain-containing protein  44.24 
 
 		 329 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0675  NERD domain-containing protein  44.86 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160777  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3374  NERD domain-containing protein  43.32 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000216973  decreased coverage  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0647  NERD domain-containing protein  43.32 
 
 		 329 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016807  hitchhiker  0.00000125306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0648  NERD domain-containing protein  42.86 
 
 		 329 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0135957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  42.99 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  43.35 
 
 		 310 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3685  NERD domain-containing protein  41.26 
 
 		 353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0218  NERD domain protein  28.57 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  26.9 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0665  HRDC domain-containing protein  24.46 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.126203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0664  HRDC domain-containing protein  24.46 
 
 		 361 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1003  NERD domain-containing protein  28.71 
 
 		 344 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  33.04 
 
 		 329 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0871  NERD domain-containing protein  30.97 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  29 
 
 		 225 aa  45.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  32.71 
 
 		 338 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  26.67 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  27.36 
 
 		 1427 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>