More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4285 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0113  protein kinase domain-containing protein  38.52 
 
 
1400 aa  822    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2952  serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 
1406 aa  690    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  100 
 
 
1427 aa  2880    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1544  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
1387 aa  633  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05120  nuclease-like protein  31.53 
 
 
1408 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.61882  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0701  serine/threonine protein kinase  30.44 
 
 
1421 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3204  protein kinase  31.04 
 
 
1405 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.375808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4796  NERD domain-containing protein  39.43 
 
 
316 aa  226  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  22.36 
 
 
1376 aa  107  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
666 aa  93.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 
1413 aa  87.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.89 
 
 
627 aa  83.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 
776 aa  82.4  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 
673 aa  81.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
641 aa  80.9  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
593 aa  80.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  27.51 
 
 
451 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
545 aa  80.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  29.32 
 
 
325 aa  80.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  24.45 
 
 
746 aa  78.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 
381 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.28 
 
 
880 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.05 
 
 
1183 aa  77  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  26.81 
 
 
625 aa  75.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.34 
 
 
653 aa  75.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  23.57 
 
 
625 aa  75.5  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  24.73 
 
 
614 aa  75.5  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.05 
 
 
621 aa  75.1  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  25.48 
 
 
1032 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3427  protein kinase  25.69 
 
 
450 aa  74.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
468 aa  73.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 
729 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 
651 aa  73.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  25.66 
 
 
1032 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
710 aa  73.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.75 
 
 
707 aa  73.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1327  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
536 aa  73.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0293261  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.61 
 
 
668 aa  72.4  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1282  serine/threonine protein kinase  23.57 
 
 
517 aa  72.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0542753  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.4 
 
 
863 aa  72.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.58 
 
 
841 aa  72.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.67 
 
 
806 aa  72.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  23.36 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1281  serine/threonine protein kinase  27.09 
 
 
429 aa  72  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.140436  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.72 
 
 
503 aa  71.6  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
498 aa  71.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  29.02 
 
 
889 aa  71.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  26.95 
 
 
593 aa  71.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 
585 aa  70.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.35 
 
 
477 aa  70.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  26.12 
 
 
467 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
610 aa  70.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  26.74 
 
 
620 aa  70.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.47 
 
 
598 aa  70.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68332  carbon catabolite derepressing ser/thr protein kinase  27.73 
 
 
580 aa  70.1  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.721612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  23.95 
 
 
1018 aa  70.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  26.21 
 
 
664 aa  69.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  26.21 
 
 
664 aa  69.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.11 
 
 
579 aa  69.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  24.45 
 
 
604 aa  69.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  31.35 
 
 
683 aa  69.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
571 aa  69.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 
502 aa  68.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.44 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2199  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0725678  hitchhiker  0.00985459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
571 aa  68.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01630  serine/threonine-protein kinase, putative  25.13 
 
 
1022 aa  68.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  26.69 
 
 
790 aa  68.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.45 
 
 
419 aa  68.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.68 
 
 
943 aa  68.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
483 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  26.07 
 
 
638 aa  68.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 
498 aa  67.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5419  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
1327 aa  67.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.14 
 
 
715 aa  67.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  24.55 
 
 
454 aa  67.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
451 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0458  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
605 aa  67.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  24.59 
 
 
620 aa  67  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
659 aa  67.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  24.73 
 
 
599 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3378  protein kinase  25.1 
 
 
544 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.48624  decreased coverage  0.000240313 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40725  predicted protein  23.81 
 
 
293 aa  67.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.316803  normal  0.0251732 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  26.34 
 
 
666 aa  66.6  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  28.93 
 
 
565 aa  66.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.4 
 
 
1044 aa  66.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1234  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.41 
 
 
297 aa  67  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  25.86 
 
 
618 aa  66.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 
439 aa  66.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 
537 aa  66.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 
569 aa  66.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
505 aa  66.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 
645 aa  66.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 
540 aa  66.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
671 aa  65.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  26.57 
 
 
589 aa  65.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25.37 
 
 
666 aa  65.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>