More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3378 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3378  protein kinase  100 
 
 
544 aa  1112    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.48624  decreased coverage  0.000240313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3456  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.07 
 
 
458 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00571523  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  33 
 
 
896 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.02 
 
 
627 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5516  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
512 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  34.28 
 
 
623 aa  145  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  34.16 
 
 
790 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 
582 aa  143  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  31.18 
 
 
692 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
691 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  32.08 
 
 
597 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 
691 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.38 
 
 
613 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.91 
 
 
603 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  33.22 
 
 
625 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 
700 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.55 
 
 
438 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 
439 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  32.97 
 
 
604 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  31.54 
 
 
621 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 
651 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
625 aa  137  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.1 
 
 
676 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.4 
 
 
528 aa  137  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
468 aa  136  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 
480 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  31.16 
 
 
667 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1553  serine/threonine protein kinase  32.66 
 
 
760 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2907  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0088  serine/threonine kinase protein  30.56 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2951  protein kinase  33.33 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426406  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  33.22 
 
 
609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 
545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.88 
 
 
601 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  30.03 
 
 
690 aa  135  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2937  protein kinase  33.69 
 
 
414 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0760127  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  33.33 
 
 
1053 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
666 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.47 
 
 
635 aa  134  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.91 
 
 
715 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 
615 aa  134  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.76 
 
 
627 aa  134  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.65 
 
 
647 aa  133  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.27 
 
 
880 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.08 
 
 
613 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  31.93 
 
 
625 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 
761 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  31.21 
 
 
614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4009  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.09 
 
 
459 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  33.45 
 
 
618 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
601 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.18 
 
 
806 aa  131  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 
700 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.44 
 
 
693 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.81 
 
 
553 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
612 aa  130  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  39.55 
 
 
464 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  32.32 
 
 
1057 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
763 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.82 
 
 
652 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  32.16 
 
 
451 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.93 
 
 
584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6426  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0541  serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 
627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.29 
 
 
664 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.79 
 
 
668 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  31.6 
 
 
820 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  31.23 
 
 
625 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.55 
 
 
863 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 
598 aa  127  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.21 
 
 
632 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.98 
 
 
658 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
642 aa  127  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.46 
 
 
681 aa  127  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.61 
 
 
594 aa  127  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
703 aa  127  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1473  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.61 
 
 
747 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0818047  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.08 
 
 
645 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.5 
 
 
668 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  31.1 
 
 
467 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2186  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.69 
 
 
610 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
451 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2434  Serine/threonine protein kinase-like  32.85 
 
 
896 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0164734  normal  0.121518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  31.58 
 
 
951 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  35.62 
 
 
399 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.06 
 
 
520 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
646 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 
773 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  31.03 
 
 
668 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
632 aa  125  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 
746 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.78 
 
 
700 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
657 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
624 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
624 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>