More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1077 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
503 aa  1035    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  60.35 
 
 
419 aa  339  9e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  41.3 
 
 
620 aa  196  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.88 
 
 
650 aa  195  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  38.01 
 
 
586 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 
565 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  38.33 
 
 
662 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  43.41 
 
 
450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.69 
 
 
662 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  37.5 
 
 
666 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  41.11 
 
 
625 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  37.92 
 
 
614 aa  184  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  42.05 
 
 
597 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.44 
 
 
668 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.78 
 
 
681 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.81 
 
 
668 aa  179  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
666 aa  179  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  41.34 
 
 
626 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 
700 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  37.91 
 
 
661 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.18 
 
 
591 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.18 
 
 
601 aa  177  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
691 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  35.67 
 
 
545 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  38.83 
 
 
646 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 
502 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  37.73 
 
 
866 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 
624 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 
624 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 
624 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 
673 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
613 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  38.04 
 
 
638 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.65 
 
 
627 aa  173  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 
776 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  36.92 
 
 
625 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.32 
 
 
551 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  37.83 
 
 
628 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.55 
 
 
693 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.1 
 
 
598 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
690 aa  172  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
632 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.88 
 
 
613 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  36.84 
 
 
664 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  36.84 
 
 
664 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  39.62 
 
 
615 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  37.5 
 
 
593 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  40.53 
 
 
625 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.78 
 
 
647 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.34 
 
 
645 aa  170  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  39.85 
 
 
582 aa  170  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.77 
 
 
648 aa  169  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  37.27 
 
 
750 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.82 
 
 
653 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.74 
 
 
579 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3039  serine/threonine protein kinase  37.28 
 
 
735 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 
641 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  36.15 
 
 
618 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  36.36 
 
 
634 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  36.71 
 
 
668 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.02 
 
 
635 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  40.07 
 
 
618 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  36.57 
 
 
666 aa  167  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  37.55 
 
 
667 aa  167  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  36.93 
 
 
439 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.33 
 
 
664 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 
650 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 
468 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  34.2 
 
 
790 aa  167  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1881  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.88 
 
 
553 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  31.21 
 
 
623 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.19 
 
 
520 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 
985 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 
710 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
651 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
653 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  37.23 
 
 
736 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  38.11 
 
 
907 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.91 
 
 
700 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.43 
 
 
657 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.32 
 
 
607 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.98 
 
 
707 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  38.26 
 
 
609 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 
723 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  35.27 
 
 
1032 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  35.69 
 
 
758 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  38.06 
 
 
646 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  34.73 
 
 
642 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 
657 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 
657 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.64 
 
 
603 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.77 
 
 
528 aa  163  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1554  serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 
531 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0554404  normal  0.189627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 
537 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 
657 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  36.52 
 
 
617 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.07 
 
 
627 aa  163  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.74 
 
 
747 aa  163  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>