More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1108 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  100 
 
 
806 aa  1638    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  50.58 
 
 
438 aa  307  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  50 
 
 
587 aa  281  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  51.2 
 
 
587 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  56.7 
 
 
430 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  51.2 
 
 
587 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  56.7 
 
 
430 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  56.7 
 
 
431 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4009  Serine/threonine protein kinase-related protein  53.68 
 
 
459 aa  275  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  50.87 
 
 
467 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  52.77 
 
 
621 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  53.26 
 
 
451 aa  265  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0720  Serine/threonine protein kinase-related protein  47.52 
 
 
584 aa  265  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  52.77 
 
 
623 aa  265  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  52.77 
 
 
623 aa  265  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  48.99 
 
 
545 aa  264  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3427  protein kinase  54.47 
 
 
450 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1234  serine/threonine protein kinase  51.97 
 
 
539 aa  260  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  50.38 
 
 
557 aa  257  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
419 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11764  anchored-membrane serine/threonine-protein kinase pknF  52.11 
 
 
476 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  47.46 
 
 
477 aa  250  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  49.61 
 
 
790 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  46.48 
 
 
671 aa  234  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
576 aa  220  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.4 
 
 
511 aa  220  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  50 
 
 
576 aa  220  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  48.02 
 
 
589 aa  218  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
349 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3912  Serine/threonine protein kinase-related protein  46.4 
 
 
574 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  46.27 
 
 
599 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  40.52 
 
 
593 aa  198  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  42.2 
 
 
776 aa  197  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12928  transmembrane serine/threonine-protein kinase I pknI  42.53 
 
 
585 aa  197  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00758832  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  45.49 
 
 
571 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  41 
 
 
624 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  41 
 
 
624 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  41 
 
 
624 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.13 
 
 
591 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  44.06 
 
 
574 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38.95 
 
 
612 aa  190  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 
585 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  42.11 
 
 
625 aa  187  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.23 
 
 
668 aa  187  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  39.5 
 
 
618 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.97 
 
 
681 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  40.38 
 
 
617 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  42.05 
 
 
626 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.06 
 
 
627 aa  184  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
666 aa  183  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 
563 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  41.73 
 
 
625 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.93 
 
 
681 aa  181  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.2 
 
 
650 aa  181  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  40.98 
 
 
444 aa  181  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  40.34 
 
 
1358 aa  180  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  38.55 
 
 
661 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 
569 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  39.53 
 
 
626 aa  180  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  39.08 
 
 
668 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.23 
 
 
676 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  36.15 
 
 
692 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.76 
 
 
715 aa  178  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  39.62 
 
 
820 aa  179  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.55 
 
 
602 aa  179  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.64 
 
 
869 aa  178  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 
691 aa  178  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  40.94 
 
 
736 aa  178  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  38.77 
 
 
664 aa  178  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.68 
 
 
406 aa  178  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.65 
 
 
662 aa  177  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.37 
 
 
517 aa  177  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.5 
 
 
653 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.96 
 
 
664 aa  178  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  42.02 
 
 
561 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.38 
 
 
693 aa  177  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5558  protein kinase  38.87 
 
 
518 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.759172 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  38.95 
 
 
634 aa  177  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  40.93 
 
 
647 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  35.84 
 
 
632 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.65 
 
 
668 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.36 
 
 
666 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.16 
 
 
635 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.38 
 
 
601 aa  176  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  38.04 
 
 
692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  40.7 
 
 
541 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  38.82 
 
 
907 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  37.33 
 
 
519 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  39.52 
 
 
557 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.36 
 
 
1044 aa  175  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 
691 aa  174  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 
537 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40 
 
 
645 aa  174  5.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.59 
 
 
916 aa  174  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  41.04 
 
 
678 aa  174  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  39.84 
 
 
530 aa  174  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.16 
 
 
648 aa  173  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  41.46 
 
 
1108 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.48 
 
 
603 aa  173  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.18 
 
 
1373 aa  173  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>