More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1544 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2952  serine/threonine protein kinase  37.86 
 
 		 1406 aa  712    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  34.61 
 
 		 1427 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1544  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1387 aa  2746    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05120  nuclease-like protein  36.83 
 
 		 1408 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.61882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0113  protein kinase domain-containing protein  33.22 
 
 		 1400 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0701  serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 		 1421 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3204  protein kinase  34.87 
 
 		 1405 aa  569  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.375808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4796  NERD domain-containing protein  37.36 
 
 		 316 aa  205  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  24.52 
 
 		 1413 aa  91.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 636 aa  77.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.67 
 
 		 1808 aa  76.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  31.89 
 
 		 564 aa  75.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 		 505 aa  73.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3828  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 		 1818 aa  72.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 		 613 aa  72  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  29.24 
 
 		 604 aa  71.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 		 683 aa  71.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.02 
 
 		 1398 aa  70.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 		 617 aa  71.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8117  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.74 
 
 		 733 aa  70.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  32.07 
 
 		 618 aa  70.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 		 776 aa  70.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.51 
 
 		 647 aa  70.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.18 
 
 		 1183 aa  70.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0099  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.05 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2849  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 709 aa  69.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  26.83 
 
 		 667 aa  69.3  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.02 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 1009 aa  68.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  27.92 
 
 		 1009 aa  68.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41102  predicted protein  30.24 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367814  normal  0.0442163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.88 
 
 		 599 aa  68.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05610  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 693 aa  68.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.850356  normal  0.365615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.63 
 
 		 627 aa  68.6  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  27.92 
 
 		 1017 aa  68.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.14 
 
 		 591 aa  68.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 		 673 aa  67.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.73 
 
 		 594 aa  67  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 		 528 aa  67  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.38 
 
 		 551 aa  67  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25.3 
 
 		 666 aa  67.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 		 666 aa  67  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  27.16 
 
 		 1053 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 		 895 aa  66.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  22.58 
 
 		 692 aa  66.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  22.58 
 
 		 691 aa  66.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 497 aa  67  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5526  predicted protein  33.33 
 
 		 258 aa  66.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  24.82 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1908  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.02 
 
 		 655 aa  66.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182347  hitchhiker  0.00089522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.34 
 
 		 598 aa  65.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.86 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  26.35 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  25.97 
 
 		 1057 aa  65.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  22.76 
 
 		 2077 aa  65.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.69 
 
 		 667 aa  65.9  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  27.03 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.56 
 
 		 825 aa  65.1  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  29.3 
 
 		 621 aa  65.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1281  serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.140436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 750 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3960  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.9 
 
 		 550 aa  64.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1553  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.79 
 
 		 630 aa  65.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25.75 
 
 		 869 aa  65.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 517 aa  65.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 655 aa  64.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 645 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 		 783 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  27.18 
 
 		 620 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  31.61 
 
 		 668 aa  64.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.08 
 
 		 1072 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.21 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70266  predicted protein  22.8 
 
 		 384 aa  63.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.797898 
 
 
-
 
NC_006686  CND05790  STE20  26.02 
 
 		 644 aa  63.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 555 aa  63.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 		 468 aa  63.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.06 
 
 		 747 aa  63.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.76 
 
 		 850 aa  63.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 		 316 aa  63.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  29.11 
 
 		 575 aa  63.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  27.1 
 
 		 620 aa  63.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  24.03 
 
 		 707 aa  63.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.65 
 
 		 1076 aa  62.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1234  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.62 
 
 		 297 aa  62.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4496  protein kinase  29.25 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 721 aa  63.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 		 503 aa  63.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1642  serine/threonine protein kinase  22.53 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.465473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>