More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2952 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2952  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1406 aa  2760    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1544  serine/threonine protein kinase  37.26 
 
 		 1387 aa  650    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  35.91 
 
 		 1427 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0113  protein kinase domain-containing protein  34.95 
 
 		 1400 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0701  serine/threonine protein kinase  33.43 
 
 		 1421 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05120  nuclease-like protein  33.89 
 
 		 1408 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.61882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3204  protein kinase  33.33 
 
 		 1405 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.375808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4796  NERD domain-containing protein  38.3 
 
 		 316 aa  199  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 1413 aa  131  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  24.17 
 
 		 1376 aa  90.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.37 
 
 		 1183 aa  72.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.9 
 
 		 647 aa  72.4  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.95 
 
 		 664 aa  72.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.91 
 
 		 627 aa  72  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 		 565 aa  70.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3960  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.58 
 
 		 550 aa  70.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.49 
 
 		 594 aa  70.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 		 615 aa  69.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  25.73 
 
 		 601 aa  69.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 710 aa  68.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  36.7 
 
 		 555 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  26.86 
 
 		 625 aa  68.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  24.27 
 
 		 692 aa  68.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.73 
 
 		 747 aa  68.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 		 776 aa  67.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  29.24 
 
 		 736 aa  67.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  29 
 
 		 406 aa  67.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.96 
 
 		 707 aa  67  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 673 aa  67.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  28.22 
 
 		 1053 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 1637 aa  66.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 636 aa  67  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  36.31 
 
 		 533 aa  67  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1908  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.9 
 
 		 655 aa  66.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182347  hitchhiker  0.00089522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  30.9 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  24.27 
 
 		 691 aa  66.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.91 
 
 		 1072 aa  66.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  26.52 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.94 
 
 		 1076 aa  65.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.21 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0956  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3828  serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 		 291 aa  64.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  25.7 
 
 		 604 aa  64.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3487  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 		 1341 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.55 
 
 		 603 aa  65.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  25.53 
 
 		 587 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 569 aa  64.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 		 602 aa  64.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 		 503 aa  64.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 		 703 aa  63.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.3 
 
 		 728 aa  64.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 		 419 aa  63.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0317  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 529 aa  63.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.149015  normal  0.367206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 		 1643 aa  63.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  30.21 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0884  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 		 636 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2681  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 		 1273 aa  63.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344562  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0497  serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  27.21 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.37 
 
 		 648 aa  62  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 646 aa  62  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.09 
 
 		 635 aa  62  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  24.41 
 
 		 582 aa  62  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  29.15 
 
 		 758 aa  61.6  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 		 863 aa  61.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 		 645 aa  61.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 1070 aa  61.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.424967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  29.33 
 
 		 407 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  26.97 
 
 		 597 aa  61.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 		 892 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2199  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 522 aa  61.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0725678  hitchhiker  0.00985459 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  25.88 
 
 		 796 aa  61.6  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.17 
 
 		 661 aa  60.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  29.48 
 
 		 672 aa  60.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  27.83 
 
 		 654 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.66 
 
 		 613 aa  60.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.99 
 
 		 562 aa  60.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.13 
 
 		 681 aa  60.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 		 691 aa  60.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 		 430 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1881  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.57 
 
 		 553 aa  60.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 		 430 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  28.51 
 
 		 403 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 		 636 aa  60.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  24.72 
 
 		 2077 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 		 431 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.82 
 
 		 518 aa  60.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  32.42 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  32.33 
 
 		 623 aa  60.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.82 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 		 1009 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 666 aa  60.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.03 
 
 		 1072 aa  60.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  26.5 
 
 		 1009 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  26.57 
 
 		 1017 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 		 538 aa  60.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.82 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>