More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1461 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  100 
 
 		 1376 aa  2860    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6346  protein kinase, putative  33.89 
 
 		 473 aa  290  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3503  serine/threonine protein kinase  35.32 
 
 		 469 aa  266  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5419  serine/threonine protein kinase  22.49 
 
 		 1327 aa  215  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 746 aa  142  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 		 1413 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 		 368 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.41 
 
 		 579 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.85 
 
 		 641 aa  116  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.13 
 
 		 551 aa  115  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.18 
 
 		 650 aa  111  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  31.75 
 
 		 692 aa  111  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 		 646 aa  110  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.24 
 
 		 614 aa  109  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  28.42 
 
 		 638 aa  108  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.04 
 
 		 863 aa  108  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 		 502 aa  108  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.18 
 
 		 667 aa  107  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.07 
 
 		 627 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  22.36 
 
 		 1427 aa  108  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  26.94 
 
 		 604 aa  107  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.39 
 
 		 1373 aa  106  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 468 aa  104  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.52 
 
 		 652 aa  103  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 		 750 aa  103  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 		 381 aa  103  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 		 573 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1881  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.77 
 
 		 553 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  29.63 
 
 		 509 aa  102  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  29.24 
 
 		 621 aa  102  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 		 419 aa  100  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.84 
 
 		 627 aa  100  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 		 1415 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 464 aa  100  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.4 
 
 		 1183 aa  100  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 703 aa  100  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 		 332 aa  100  2e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  27.96 
 
 		 692 aa  99.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 		 691 aa  99.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 973 aa  99.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4621  adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 		 687 aa  98.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.828122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 		 1435 aa  98.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 763 aa  98.6  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.81 
 
 		 757 aa  98.2  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 		 990 aa  97.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 		 651 aa  97.8  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.04 
 
 		 520 aa  98.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 		 450 aa  97.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 895 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 		 641 aa  96.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 982 aa  96.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.71 
 
 		 715 aa  96.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.24 
 
 		 602 aa  96.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.42 
 
 		 584 aa  96.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.77 
 
 		 632 aa  96.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.68 
 
 		 645 aa  96.3  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 		 498 aa  95.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  31.19 
 
 		 377 aa  95.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0821  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.72 
 
 		 525 aa  95.5  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  30.26 
 
 		 668 aa  95.5  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.81 
 
 		 476 aa  95.1  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  26.39 
 
 		 2051 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 		 620 aa  94.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 		 985 aa  94  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 666 aa  94  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 464 aa  94  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 		 557 aa  93.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 		 1104 aa  94  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3237  serine/threonine protein kinase  24.41 
 
 		 1243 aa  94  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.2 
 
 		 880 aa  94  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 		 537 aa  94  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  28.52 
 
 		 617 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1394  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 		 501 aa  93.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.860745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 612 aa  93.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 		 612 aa  93.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 		 651 aa  92.8  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 		 982 aa  92.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  28.89 
 
 		 963 aa  92.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 		 411 aa  92.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.33 
 
 		 531 aa  92.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 442 aa  92.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 625 aa  92.4  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 486 aa  92  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 		 621 aa  92.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  27.05 
 
 		 620 aa  92  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 		 461 aa  92  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 674 aa  91.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 		 602 aa  91.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  26.37 
 
 		 623 aa  91.7  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.71 
 
 		 642 aa  91.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 1383 aa  91.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.97 
 
 		 545 aa  90.9  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 		 525 aa  90.9  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 		 624 aa  91.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.31 
 
 		 666 aa  91.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 		 624 aa  91.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 		 624 aa  91.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  30.45 
 
 		 575 aa  91.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.32 
 
 		 634 aa  91.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  29.83 
 
 		 593 aa  91.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>