More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0378 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 
545 aa  1119    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  80.92 
 
 
545 aa  907    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4312  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.13 
 
 
554 aa  346  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.57 
 
 
623 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  35.13 
 
 
638 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 
612 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.13 
 
 
627 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.79 
 
 
598 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 
612 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.65 
 
 
650 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.54 
 
 
593 aa  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.89 
 
 
658 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.79 
 
 
652 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.32 
 
 
591 aa  153  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.44 
 
 
1205 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 
703 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.05 
 
 
579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
862 aa  146  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.09 
 
 
715 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.89 
 
 
602 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.78 
 
 
584 aa  144  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.25 
 
 
627 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  33.1 
 
 
621 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  33.81 
 
 
692 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 
1078 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  31.83 
 
 
604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.45 
 
 
1373 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
973 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 
338 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.17 
 
 
632 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
651 aa  140  7e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  31.31 
 
 
672 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  33.57 
 
 
623 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 
900 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.23 
 
 
667 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.05 
 
 
798 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 
1479 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 
468 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.36 
 
 
662 aa  137  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  33.44 
 
 
951 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
562 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 
1435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.61 
 
 
587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
666 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  29.51 
 
 
692 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
691 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  32.98 
 
 
656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2641  serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 
382 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.643401 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.14 
 
 
869 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 
653 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.74 
 
 
641 aa  134  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  30.08 
 
 
1242 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.89 
 
 
647 aa  134  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.85 
 
 
613 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
502 aa  133  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 
915 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.97 
 
 
943 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  28.29 
 
 
1330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
642 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.77 
 
 
647 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2579  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
389 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41999  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.86 
 
 
668 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  33.44 
 
 
582 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1136  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.92 
 
 
486 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.41 
 
 
653 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
657 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
528 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 
750 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  33.44 
 
 
776 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  34.7 
 
 
972 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.82 
 
 
757 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 
636 aa  130  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.28 
 
 
657 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 
625 aa  130  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.42 
 
 
1036 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 
651 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
657 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  33.68 
 
 
617 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.64 
 
 
603 aa  130  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
1085 aa  130  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.65 
 
 
1599 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
646 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.52 
 
 
666 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  32.74 
 
 
620 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  33.23 
 
 
623 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.46 
 
 
601 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
1046 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.83 
 
 
1398 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.11 
 
 
445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.25 
 
 
602 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
895 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>