More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3503 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6346  protein kinase, putative  73.25 
 
 
473 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3503  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
469 aa  939    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  35.32 
 
 
1376 aa  266  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 
1413 aa  93.6  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
776 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 
763 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 
750 aa  90.1  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 
517 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
612 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
673 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 
641 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  29.82 
 
 
621 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.28 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
625 aa  79  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5419  serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 
1327 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56396  Ribosomal protein S6 kinase and related proteins  27.27 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2600  protein kinase  25.87 
 
 
629 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212031  normal  0.220118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  27.82 
 
 
604 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.12 
 
 
653 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.59 
 
 
632 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3237  serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 
1243 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657136  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.77 
 
 
584 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.57 
 
 
657 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  27.93 
 
 
656 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  31 
 
 
623 aa  75.1  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.11 
 
 
627 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.25 
 
 
650 aa  74.3  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.86 
 
 
1072 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  28.9 
 
 
638 aa  73.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  28.57 
 
 
2051 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.57 
 
 
1076 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
628 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  27.21 
 
 
593 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 
581 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3720  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 
636 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00169428  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 
651 aa  72  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.66 
 
 
715 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.42 
 
 
1072 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.17 
 
 
662 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.49 
 
 
668 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.4 
 
 
1797 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 
708 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 
746 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48805  predicted protein  29.58 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 
651 aa  70.9  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
657 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
657 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
657 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
657 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
657 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
657 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1869  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
641 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04980  serine/threonine protein kinase, putative (Eurofung)  28.77 
 
 
607 aa  70.1  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0112908  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
657 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
657 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.51 
 
 
2017 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
657 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.32 
 
 
613 aa  70.1  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.95 
 
 
602 aa  70.1  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
612 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  21.79 
 
 
666 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  29.52 
 
 
634 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0009  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.07 
 
 
620 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5518  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.889876  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
617 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1720  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
632 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.314781  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
582 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  29.55 
 
 
620 aa  69.7  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 
1188 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 
982 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.58 
 
 
667 aa  68.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  36.3 
 
 
1833 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  24.66 
 
 
509 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.04 
 
 
1795 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
567 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.46 
 
 
627 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3119  predicted protein  26.9 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.610467  normal  0.0837715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1404  serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 
716 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 
985 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0999  serine/threonine kinase protein  26.92 
 
 
896 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.79 
 
 
1804 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 
645 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.28 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2051  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0809691  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1920  serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 
338 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
757 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 
703 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.7 
 
 
540 aa  67  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
469 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 
623 aa  67  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
465 aa  67  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
780 aa  67  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  28.27 
 
 
662 aa  66.6  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.63 
 
 
603 aa  67  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>