More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1201 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1413 aa  2772    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2952  serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 
1406 aa  143  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  23.72 
 
 
1376 aa  129  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0113  protein kinase domain-containing protein  25.16 
 
 
1400 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5419  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1327 aa  104  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.77 
 
 
1808 aa  95.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
537 aa  94  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6346  protein kinase, putative  24.83 
 
 
473 aa  94  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  23.45 
 
 
1427 aa  94  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3503  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 
469 aa  92.8  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 
1415 aa  91.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3204  protein kinase  24.23 
 
 
1405 aa  92  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.375808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  30.13 
 
 
455 aa  91.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.09 
 
 
1023 aa  90.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1111  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.5 
 
 
741 aa  89.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621151  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.24 
 
 
1666 aa  89  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 
565 aa  89  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1544  serine/threonine protein kinase  24 
 
 
1387 aa  89  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
2077 aa  88.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 
638 aa  87.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.64 
 
 
627 aa  87.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
338 aa  87  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0497  hypothetical protein  38.27 
 
 
653 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
898 aa  86.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  31.58 
 
 
643 aa  86.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  27.86 
 
 
621 aa  85.1  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
891 aa  85.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.73 
 
 
822 aa  85.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.17 
 
 
607 aa  84.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  25.07 
 
 
623 aa  84.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  31.92 
 
 
617 aa  84.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.8 
 
 
505 aa  84  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3878  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
396 aa  84.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 
746 aa  84  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  30.35 
 
 
572 aa  83.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  30.48 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
1320 aa  82.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
651 aa  82  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  29.13 
 
 
1850 aa  82  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
469 aa  82  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3125  protein kinase  28.12 
 
 
466 aa  82  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0701  serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 
1421 aa  82  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 
479 aa  81.6  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  30.88 
 
 
465 aa  82  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  29.48 
 
 
519 aa  81.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3623  serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
715 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.569481 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  29.27 
 
 
625 aa  81.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  34.31 
 
 
1885 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5516  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 
512 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  28.5 
 
 
658 aa  81.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
1942 aa  81.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
466 aa  81.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.44 
 
 
1901 aa  80.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  30.52 
 
 
620 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3248  serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 
752 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 
938 aa  80.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
466 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
1198 aa  80.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  34.1 
 
 
1032 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  29.41 
 
 
583 aa  80.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3418  hypothetical protein  30 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3134  Serine/threonine protein kinase  30 
 
 
427 aa  79.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.43 
 
 
446 aa  79.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
628 aa  79.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 
581 aa  79.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3872  protein kinase  30 
 
 
424 aa  79.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0696421  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  29.41 
 
 
1358 aa  79.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  27.45 
 
 
593 aa  79.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.38 
 
 
620 aa  79  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  31.28 
 
 
651 aa  79  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 
588 aa  79  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  27.11 
 
 
597 aa  79  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  26.78 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.43 
 
 
1804 aa  78.2  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.45 
 
 
728 aa  78.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 
461 aa  78.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2563  serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 
476 aa  77.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000933415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
450 aa  77.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
1644 aa  78.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
483 aa  77.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
583 aa  78.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
419 aa  77.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 
721 aa  77  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  31.75 
 
 
1018 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 
344 aa  77  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.88 
 
 
627 aa  77.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.94 
 
 
598 aa  77.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
1479 aa  77.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  27.84 
 
 
661 aa  76.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
707 aa  76.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  25.85 
 
 
1805 aa  76.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 
624 aa  76.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 
624 aa  76.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  29.1 
 
 
654 aa  76.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0227  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.94 
 
 
565 aa  76.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499736  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  27.61 
 
 
586 aa  76.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  26.82 
 
 
574 aa  76.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>