More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3032 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  69.77 
 
 
479 aa  668    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
483 aa  971    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  54.68 
 
 
485 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  52.97 
 
 
469 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  52.65 
 
 
478 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  52.85 
 
 
479 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  52.2 
 
 
486 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  53.09 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  48.63 
 
 
466 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  48.2 
 
 
466 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  48.2 
 
 
469 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  46.99 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  46.43 
 
 
481 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  43.36 
 
 
479 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  43.98 
 
 
481 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  43.15 
 
 
479 aa  343  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  38.43 
 
 
472 aa  323  6e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1751  serine/threonine protein kinase  41.26 
 
 
214 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.868443  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.96 
 
 
650 aa  143  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  32.27 
 
 
325 aa  142  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  34.42 
 
 
1053 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  31.38 
 
 
862 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.94 
 
 
863 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.01 
 
 
822 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  33.21 
 
 
617 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
651 aa  134  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  32.64 
 
 
533 aa  133  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  34.43 
 
 
1057 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6420  serine/threonine protein kinase  34 
 
 
511 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 
557 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
1340 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
783 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  32.45 
 
 
621 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.97 
 
 
598 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  32.53 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  32.49 
 
 
700 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  32.34 
 
 
556 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 
938 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  31.82 
 
 
618 aa  127  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.23 
 
 
798 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 
915 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  32.4 
 
 
555 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.62 
 
 
641 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5516  serine/threonine protein kinase  29.72 
 
 
512 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.64 
 
 
715 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  31.6 
 
 
556 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  32.18 
 
 
593 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  33.46 
 
 
556 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  33.33 
 
 
553 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.84 
 
 
880 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
502 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 
455 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 
468 aa  124  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
520 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 
562 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  32.85 
 
 
454 aa  123  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.07 
 
 
635 aa  123  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.09 
 
 
511 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
636 aa  123  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  33.45 
 
 
519 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  31.97 
 
 
555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
894 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3040  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 
691 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.97 
 
 
757 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.29 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0821  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.5 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
612 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.18 
 
 
591 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 
647 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 
678 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.28 
 
 
728 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.83 
 
 
692 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.21 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.2 
 
 
916 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0541  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
627 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.8 
 
 
584 aa  118  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
528 aa  118  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.86 
 
 
681 aa  118  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  32.31 
 
 
554 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.08 
 
 
667 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.77 
 
 
700 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  31.79 
 
 
1034 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.3 
 
 
1023 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
773 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  30.32 
 
 
579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.44 
 
 
627 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
612 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
498 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0154  serine/threonine-protein kinase  35.8 
 
 
447 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.56 
 
 
613 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  31.11 
 
 
563 aa  116  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.32 
 
 
747 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  29.15 
 
 
403 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  31.34 
 
 
661 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
606 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  32.06 
 
 
1073 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
1479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>