More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05120  nuclease-like protein  100 
 
 		 1408 aa  2796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.61882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0701  serine/threonine protein kinase  40.75 
 
 		 1421 aa  804    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1544  serine/threonine protein kinase  36.93 
 
 		 1387 aa  602  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2952  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 		 1406 aa  531  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  31.39 
 
 		 1427 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0113  protein kinase domain-containing protein  31.61 
 
 		 1400 aa  476  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3204  protein kinase  33.05 
 
 		 1405 aa  446  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.375808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4796  NERD domain-containing protein  42.38 
 
 		 316 aa  231  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.41 
 
 		 1044 aa  77.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.07 
 
 		 627 aa  75.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.14 
 
 		 806 aa  71.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  25.09 
 
 		 614 aa  70.1  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.72 
 
 		 591 aa  69.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  26.13 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.64 
 
 		 652 aa  68.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  25.52 
 
 		 604 aa  67.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  22.85 
 
 		 1376 aa  67.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.33 
 
 		 598 aa  67.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.76 
 
 		 1373 aa  66.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  26.97 
 
 		 593 aa  66.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  22.83 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 		 642 aa  65.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  28.42 
 
 		 625 aa  65.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0497  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5794  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 1309 aa  65.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  22.56 
 
 		 1413 aa  65.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3944  Serine/threonine protein kinase-like  22.15 
 
 		 700 aa  64.3  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.147415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  26.96 
 
 		 519 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  25.36 
 
 		 621 aa  63.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.62 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  24.7 
 
 		 746 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 545 aa  63.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05973  serine/threonine protein kinase (YPK1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10620)  26.04 
 
 		 640 aa  62.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.403248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  27.87 
 
 		 951 aa  63.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01630  serine/threonine-protein kinase, putative  23.7 
 
 		 1022 aa  62.4  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27.21 
 
 		 666 aa  62.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  29.75 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68202  cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit  24.93 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.303606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1771  protein kinase  28.9 
 
 		 425 aa  62  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 		 602 aa  62  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  23.49 
 
 		 666 aa  61.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2683  ATP-binding region ATPase domain protein  29.87 
 
 		 746 aa  61.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.301078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  26.54 
 
 		 574 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  22.76 
 
 		 664 aa  61.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  22.76 
 
 		 664 aa  61.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  25 
 
 		 623 aa  60.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  26.8 
 
 		 561 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 646 aa  60.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  31.07 
 
 		 553 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  24.58 
 
 		 841 aa  60.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 		 502 aa  60.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 344 aa  60.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 610 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  32 
 
 		 623 aa  60.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  26.16 
 
 		 613 aa  59.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  26.02 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3308  Serine/threonine protein kinase  25.32 
 
 		 601 aa  59.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.04 
 
 		 657 aa  59.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  26.77 
 
 		 618 aa  59.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6482  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 		 591 aa  59.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 710 aa  59.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.28 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 		 690 aa  59.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  31.49 
 
 		 758 aa  59.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 1415 aa  59.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 1122 aa  58.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  22.22 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.93 
 
 		 601 aa  58.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.34 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  26.1 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3503  serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 464 aa  58.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70266  predicted protein  23.17 
 
 		 384 aa  58.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.797898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  30.98 
 
 		 556 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  27.48 
 
 		 617 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 419 aa  58.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 		 632 aa  58.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0541  serine/threonine protein kinase  23.29 
 
 		 627 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 		 461 aa  57.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 505 aa  57  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 338 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  23.21 
 
 		 565 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1881  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.05 
 
 		 553 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 		 647 aa  57  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 559 aa  57.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  28.96 
 
 		 555 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  23.1 
 
 		 1070 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.424967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 729 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 		 657 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3629  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 		 371 aa  56.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 		 628 aa  56.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  32.95 
 
 		 559 aa  57  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  21.51 
 
 		 625 aa  56.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 		 632 aa  56.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.89 
 
 		 627 aa  57  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.28 
 
 		 664 aa  56.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  26.7 
 
 		 513 aa  57  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>