More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1602 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  95.34 
 
 		 556 aa  1021    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  68.3 
 
 		 529 aa  739    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  69.46 
 
 		 553 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  74.67 
 
 		 556 aa  816    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 556 aa  1101    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  71 
 
 		 559 aa  737    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  70.5 
 
 		 554 aa  729    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  94.79 
 
 		 556 aa  1017    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  69.27 
 
 		 555 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  90.5 
 
 		 555 aa  968    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  68.54 
 
 		 533 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  45.29 
 
 		 565 aa  438  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  44.73 
 
 		 562 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  40.7 
 
 		 580 aa  361  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 566 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  39.25 
 
 		 594 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 		 573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  40.46 
 
 		 582 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  38.9 
 
 		 595 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  36.41 
 
 		 563 aa  304  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 		 574 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  35.05 
 
 		 571 aa  296  9e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 		 596 aa  273  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 		 570 aa  269  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  33.28 
 
 		 577 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 		 574 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 589 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 		 577 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 572 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  29.32 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 		 569 aa  249  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  31.7 
 
 		 571 aa  247  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 		 585 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  31.12 
 
 		 576 aa  246  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 599 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 596 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 610 aa  243  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  32.46 
 
 		 591 aa  242  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 		 621 aa  240  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 		 606 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 576 aa  238  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  30.12 
 
 		 580 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  51.95 
 
 		 705 aa  233  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 586 aa  233  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  32.8 
 
 		 579 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  28.5 
 
 		 590 aa  225  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 		 548 aa  187  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 		 605 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  26.16 
 
 		 667 aa  153  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 		 700 aa  136  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  29.17 
 
 		 472 aa  124  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  29.47 
 
 		 465 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 479 aa  120  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  32.25 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.1 
 
 		 598 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  33.69 
 
 		 469 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.11 
 
 		 1110 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1671  protein kinase  37.64 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.23 
 
 		 666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 479 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.05 
 
 		 747 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  32.21 
 
 		 466 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.63 
 
 		 602 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  30.94 
 
 		 617 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  37.84 
 
 		 557 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  38.33 
 
 		 352 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.08 
 
 		 614 aa  108  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  31.01 
 
 		 481 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  33.66 
 
 		 325 aa  107  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  24.16 
 
 		 761 aa  107  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 1415 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 		 626 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5082  protein kinase  34.97 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 		 416 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 		 582 aa  104  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  31.58 
 
 		 790 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3944  Serine/threonine protein kinase-like  27.48 
 
 		 700 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.147415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 		 666 aa  103  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  31.86 
 
 		 620 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 651 aa  103  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.39 
 
 		 880 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 		 777 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.15 
 
 		 1044 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 		 982 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.21 
 
 		 641 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.24 
 
 		 667 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.28 
 
 		 528 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>