More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3649 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  98.74 
 
 		 556 aa  1094    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  68.49 
 
 		 529 aa  742    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  90.88 
 
 		 555 aa  971    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  69.09 
 
 		 553 aa  748    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  73.93 
 
 		 556 aa  808    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  69.33 
 
 		 559 aa  726    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  100 
 
 		 556 aa  1106    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  94.79 
 
 		 556 aa  1017    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  69.09 
 
 		 555 aa  719    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  68.16 
 
 		 533 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  69.57 
 
 		 554 aa  721    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  46.18 
 
 		 565 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  45.27 
 
 		 562 aa  440  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  39.47 
 
 		 580 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  39.69 
 
 		 594 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  39.33 
 
 		 573 aa  346  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  40.28 
 
 		 566 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  40.03 
 
 		 582 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  38.72 
 
 		 595 aa  325  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  36.78 
 
 		 563 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  34.49 
 
 		 571 aa  293  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 574 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 577 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 		 574 aa  267  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 596 aa  267  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 		 572 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 		 577 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 		 571 aa  256  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 		 589 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  32.62 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 574 aa  250  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 		 585 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  31.88 
 
 		 591 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  27.34 
 
 		 569 aa  244  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 		 621 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  26.41 
 
 		 569 aa  243  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 		 599 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 		 586 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 		 576 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 		 606 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  52.53 
 
 		 705 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  30.02 
 
 		 580 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  32.26 
 
 		 579 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  27.98 
 
 		 590 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 		 605 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  26.32 
 
 		 667 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  23.59 
 
 		 700 aa  133  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  29.27 
 
 		 472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 483 aa  124  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.47 
 
 		 598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 		 479 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.67 
 
 		 666 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 479 aa  117  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  29.12 
 
 		 465 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.39 
 
 		 1110 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.32 
 
 		 614 aa  113  9e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.68 
 
 		 747 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.85 
 
 		 658 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 		 502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  28.32 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 557 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  33.33 
 
 		 790 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.18 
 
 		 602 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  30 
 
 		 617 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 		 651 aa  109  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.73 
 
 		 667 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.92 
 
 		 634 aa  109  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 466 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1671  protein kinase  37.08 
 
 		 301 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 		 1415 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 479 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 		 416 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  30.58 
 
 		 469 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  30.57 
 
 		 692 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  31.46 
 
 		 662 aa  108  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.12 
 
 		 632 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  37.78 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 		 381 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  36.02 
 
 		 636 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 1479 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.22 
 
 		 880 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 		 517 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  30.68 
 
 		 638 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  28.81 
 
 		 618 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28 
 
 		 662 aa  105  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>