More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2316 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  70.69 
 
 
580 aa  758    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  66.96 
 
 
566 aa  723    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  100 
 
 
573 aa  1135    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  58.15 
 
 
594 aa  633  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  57.62 
 
 
582 aa  627  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  43.35 
 
 
562 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  42.21 
 
 
565 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  42.68 
 
 
555 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  39.96 
 
 
555 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  39.34 
 
 
556 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  39.16 
 
 
556 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  42.39 
 
 
533 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  39.03 
 
 
529 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  40.4 
 
 
559 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  38.5 
 
 
556 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  38.25 
 
 
556 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  40.47 
 
 
554 aa  321  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  37.79 
 
 
553 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  39.86 
 
 
563 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  36.35 
 
 
571 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  36.59 
 
 
595 aa  270  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  30.26 
 
 
576 aa  262  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 
570 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  29.16 
 
 
574 aa  240  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
589 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
610 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  29.2 
 
 
590 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
576 aa  231  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
574 aa  227  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 
577 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
569 aa  225  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 
577 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  28.67 
 
 
591 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
596 aa  217  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  28.4 
 
 
569 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 
585 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 
574 aa  213  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
621 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
586 aa  209  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 
571 aa  207  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  31.57 
 
 
579 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
574 aa  205  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
572 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  31.29 
 
 
571 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  47.29 
 
 
705 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  27.59 
 
 
580 aa  196  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
599 aa  194  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 
606 aa  193  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  26.11 
 
 
596 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  25.08 
 
 
605 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  33.57 
 
 
618 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.71 
 
 
594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
598 aa  128  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.75 
 
 
863 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 
615 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.48 
 
 
598 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.81 
 
 
666 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.54 
 
 
613 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.17 
 
 
681 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.24 
 
 
627 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.49 
 
 
880 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  32.4 
 
 
661 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  28.52 
 
 
625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.99 
 
 
916 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  27.96 
 
 
692 aa  113  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  30.55 
 
 
700 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 
691 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.32 
 
 
1110 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
642 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  28.81 
 
 
889 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.43 
 
 
632 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.37 
 
 
747 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.86 
 
 
676 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  29.62 
 
 
325 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.76 
 
 
1023 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
543 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35 
 
 
613 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 
761 aa  110  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
703 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.43 
 
 
693 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
486 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.03 
 
 
896 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  31.02 
 
 
638 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 
455 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
520 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
517 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
1415 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.94 
 
 
667 aa  107  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  31.25 
 
 
672 aa  107  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
569 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.44 
 
 
579 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
646 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 
381 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
938 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  35.52 
 
 
620 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  34.5 
 
 
609 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.3 
 
 
943 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
565 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
746 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>