More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2303 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  69.01 
 
 		 556 aa  728    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  100 
 
 		 529 aa  1068    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  89.22 
 
 		 553 aa  944    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  73.1 
 
 		 556 aa  765    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  70.12 
 
 		 559 aa  711    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  69.2 
 
 		 556 aa  728    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  67.38 
 
 		 555 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  67.96 
 
 		 554 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  69.34 
 
 		 555 aa  725    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  66.8 
 
 		 533 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  69.01 
 
 		 556 aa  724    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  44.3 
 
 		 565 aa  415  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  42.8 
 
 		 562 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  40.87 
 
 		 566 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  39.03 
 
 		 573 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  40.04 
 
 		 582 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  38.62 
 
 		 594 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  36.76 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  36.87 
 
 		 580 aa  293  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  35.48 
 
 		 563 aa  289  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  33.53 
 
 		 571 aa  270  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 		 570 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 		 574 aa  266  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 572 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 		 577 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 		 577 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 		 574 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 596 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 606 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  29.68 
 
 		 576 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  30.21 
 
 		 590 aa  237  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  31.42 
 
 		 591 aa  236  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  32.15 
 
 		 585 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  30.77 
 
 		 571 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 589 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 		 574 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  29.09 
 
 		 580 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 569 aa  229  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 		 576 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 		 621 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  29.42 
 
 		 569 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  44.03 
 
 		 705 aa  223  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 		 610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  31.36 
 
 		 579 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 548 aa  176  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  25.04 
 
 		 667 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  25.04 
 
 		 605 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 700 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 761 aa  130  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 485 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.23 
 
 		 747 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  34.55 
 
 		 325 aa  123  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  27.36 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.23 
 
 		 658 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.21 
 
 		 591 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  36.57 
 
 		 662 aa  118  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.86 
 
 		 594 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.19 
 
 		 1110 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  35.45 
 
 		 618 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.5 
 
 		 632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  32.33 
 
 		 790 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  33.76 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 		 615 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.84 
 
 		 666 aa  115  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 479 aa  115  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  34.95 
 
 		 614 aa  114  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 		 479 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  34.52 
 
 		 625 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 		 481 aa  113  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.92 
 
 		 627 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.94 
 
 		 593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.54 
 
 		 511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.75 
 
 		 869 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.33 
 
 		 601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  30.17 
 
 		 666 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 425 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.4 
 
 		 681 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  27.55 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  28.76 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 		 421 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  25.99 
 
 		 457 aa  110  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 		 626 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.02 
 
 		 668 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.36 
 
 		 715 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  40.76 
 
 		 646 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  30.77 
 
 		 664 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>