More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1550 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  100 
 
 
667 aa  1381    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  60.64 
 
 
700 aa  781    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
574 aa  220  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  29 
 
 
591 aa  212  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
589 aa  207  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 
574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 
574 aa  200  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  26.12 
 
 
572 aa  200  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  27.49 
 
 
580 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  26.74 
 
 
590 aa  195  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
577 aa  191  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  27.09 
 
 
569 aa  189  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  26.34 
 
 
571 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 
574 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 
596 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 
599 aa  181  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 
606 aa  181  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  26.22 
 
 
579 aa  181  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 
577 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  26.65 
 
 
571 aa  179  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 
610 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 
596 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  25.04 
 
 
529 aa  167  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  23.99 
 
 
569 aa  165  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 
585 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
605 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 
621 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  25.57 
 
 
553 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 
576 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  23.57 
 
 
576 aa  152  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  26.07 
 
 
556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 
586 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  26.07 
 
 
556 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  25.91 
 
 
556 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  25.54 
 
 
555 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  25.33 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  23.98 
 
 
554 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  24.68 
 
 
559 aa  121  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  24.37 
 
 
595 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  24.29 
 
 
548 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  23.31 
 
 
571 aa  112  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  23.12 
 
 
580 aa  108  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  24.36 
 
 
594 aa  106  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  32.2 
 
 
621 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 
703 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.14 
 
 
579 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  28.23 
 
 
625 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.24 
 
 
715 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  26.24 
 
 
634 aa  99.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
625 aa  99.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.85 
 
 
641 aa  98.6  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  24.69 
 
 
582 aa  98.2  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.27 
 
 
635 aa  97.8  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.7 
 
 
627 aa  97.8  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.37 
 
 
916 aa  97.4  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 
651 aa  96.3  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  22.04 
 
 
563 aa  95.5  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.51 
 
 
662 aa  95.1  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  22.45 
 
 
573 aa  94.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  22.56 
 
 
562 aa  94.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
662 aa  94.7  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.19 
 
 
627 aa  94.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.3 
 
 
650 aa  94.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  28.28 
 
 
668 aa  94.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00370  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
419 aa  94.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.339035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.89 
 
 
653 aa  94.4  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.1 
 
 
664 aa  94  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  23.4 
 
 
566 aa  94  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.64 
 
 
668 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  27.89 
 
 
623 aa  93.2  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  22.46 
 
 
533 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
567 aa  92  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.39 
 
 
591 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  31.72 
 
 
593 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.05 
 
 
647 aa  91.3  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.59 
 
 
505 aa  91.3  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
645 aa  90.9  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  28.23 
 
 
555 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
582 aa  90.1  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 
612 aa  89.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  21.56 
 
 
565 aa  88.6  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
750 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  26.34 
 
 
692 aa  88.6  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 
468 aa  89  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.32 
 
 
614 aa  88.2  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.15 
 
 
681 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.3 
 
 
445 aa  88.6  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.55 
 
 
676 aa  88.6  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  28.65 
 
 
469 aa  88.2  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
691 aa  88.2  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.73 
 
 
681 aa  87.4  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.17 
 
 
632 aa  87.4  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  36.84 
 
 
436 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
691 aa  87  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
503 aa  87  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
464 aa  87  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.19 
 
 
598 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 
624 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.02 
 
 
880 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>