More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3205 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
571 aa  1141    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  49.53 
 
 
595 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  46.81 
 
 
563 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  40 
 
 
562 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  36.54 
 
 
565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  36.1 
 
 
555 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  36.81 
 
 
554 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  35.05 
 
 
556 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
573 aa  296  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  34.31 
 
 
556 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  34.49 
 
 
556 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  35.78 
 
 
559 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  34.74 
 
 
579 aa  290  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
574 aa  289  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  34.38 
 
 
556 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 
596 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  34.99 
 
 
555 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
577 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  33.82 
 
 
553 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 
589 aa  277  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  33.63 
 
 
582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
574 aa  273  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  33.46 
 
 
529 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  32.29 
 
 
594 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  34.99 
 
 
566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
577 aa  270  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  34.82 
 
 
533 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  34.21 
 
 
580 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
621 aa  266  7e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 
599 aa  266  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  31.29 
 
 
591 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  30.65 
 
 
580 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
571 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  32.19 
 
 
571 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 
585 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 
574 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
574 aa  258  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 
576 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  30.17 
 
 
576 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  29.32 
 
 
590 aa  253  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
572 aa  253  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  28.7 
 
 
569 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
570 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  29.97 
 
 
606 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
586 aa  244  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
610 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 
596 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  41.63 
 
 
705 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
605 aa  188  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  26.78 
 
 
548 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  31 
 
 
325 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 
344 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
328 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  30.92 
 
 
586 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.37 
 
 
1044 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
653 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
773 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 
982 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  33.6 
 
 
1100 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  34.92 
 
 
540 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.46 
 
 
715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
502 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
650 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.2 
 
 
666 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 
531 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2732  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
563 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.420393 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
636 aa  117  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
695 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 
419 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
982 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 
1479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.69 
 
 
662 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  22.51 
 
 
667 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  33.73 
 
 
963 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.62 
 
 
598 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  36.07 
 
 
452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.55 
 
 
1655 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.95 
 
 
878 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  30.89 
 
 
620 aa  113  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3747  serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 
619 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.350974  normal  0.548904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 
985 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 
1070 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.424967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
895 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  20.87 
 
 
700 aa  111  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 
450 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.27 
 
 
1076 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.2 
 
 
842 aa  111  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  32.42 
 
 
477 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  38.1 
 
 
395 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.86 
 
 
1072 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
349 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  32.82 
 
 
394 aa  110  9.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
1072 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1729  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 
301 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.372145  normal  0.952904 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 
761 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
483 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 
783 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
866 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>