More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2677 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 580 aa  1157    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  64.84 
 
 		 566 aa  712    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  70.69 
 
 		 573 aa  801    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  57.45 
 
 		 594 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  57.24 
 
 		 582 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  41.43 
 
 		 562 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  42.24 
 
 		 565 aa  392  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  41 
 
 		 556 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  40.29 
 
 		 556 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  40.21 
 
 		 555 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  39.75 
 
 		 556 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  41.18 
 
 		 554 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  40.43 
 
 		 555 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  37.97 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  39.74 
 
 		 533 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  37.36 
 
 		 529 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  37.99 
 
 		 559 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  36.07 
 
 		 553 aa  300  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  37.65 
 
 		 563 aa  282  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  35.42 
 
 		 595 aa  276  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  34.29 
 
 		 571 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 610 aa  243  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  29.42 
 
 		 574 aa  242  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  29.95 
 
 		 576 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 		 574 aa  224  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  27.94 
 
 		 590 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  31.63 
 
 		 579 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  31.24 
 
 		 577 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 		 576 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 589 aa  217  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 		 574 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  30.76 
 
 		 572 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 621 aa  211  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  48.29 
 
 		 705 aa  211  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 569 aa  208  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 		 585 aa  208  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 571 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  26.92 
 
 		 580 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  26.83 
 
 		 591 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  29.29 
 
 		 571 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 		 574 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  27.11 
 
 		 569 aa  198  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  25.57 
 
 		 596 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 		 586 aa  190  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 		 606 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 		 599 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 		 605 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  33.22 
 
 		 618 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.45 
 
 		 598 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 615 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 		 594 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 598 aa  128  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  32.17 
 
 		 609 aa  126  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 		 548 aa  126  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.46 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.25 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.24 
 
 		 863 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.17 
 
 		 627 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.15 
 
 		 666 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.03 
 
 		 613 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  35.55 
 
 		 582 aa  121  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 		 618 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.98 
 
 		 667 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.5 
 
 		 652 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  31.97 
 
 		 325 aa  118  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  29.64 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  28.67 
 
 		 692 aa  118  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.56 
 
 		 647 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.37 
 
 		 880 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 		 478 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 700 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.98 
 
 		 798 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.07 
 
 		 1023 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.51 
 
 		 579 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.6 
 
 		 676 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.02 
 
 		 916 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.24 
 
 		 747 aa  114  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.59 
 
 		 658 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.25 
 
 		 681 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 		 703 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.87 
 
 		 1110 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  29.8 
 
 		 593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  29 
 
 		 612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  32.26 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  31.16 
 
 		 672 aa  112  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  28.52 
 
 		 889 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  32.49 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.74 
 
 		 661 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.23 
 
 		 584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 938 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  23.06 
 
 		 667 aa  110  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>