More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0593 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  100 
 
 
595 aa  1188    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  49.72 
 
 
571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  45.65 
 
 
563 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  41.35 
 
 
562 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  41.74 
 
 
554 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  38.83 
 
 
556 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  38.64 
 
 
556 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  38.64 
 
 
556 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  37.88 
 
 
565 aa  340  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  38.83 
 
 
555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  38.17 
 
 
556 aa  334  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  39.22 
 
 
559 aa  330  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  37.11 
 
 
529 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  38.06 
 
 
555 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  36.45 
 
 
553 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  38.48 
 
 
533 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  35.73 
 
 
579 aa  300  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
574 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  31.08 
 
 
590 aa  286  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  35.52 
 
 
580 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
577 aa  282  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
577 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  36.58 
 
 
573 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
596 aa  276  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
589 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  34.09 
 
 
594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  34.12 
 
 
571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  29.46 
 
 
569 aa  269  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
566 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  31.04 
 
 
580 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  30.42 
 
 
591 aa  266  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 
569 aa  266  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
572 aa  264  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 
586 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
574 aa  257  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 
610 aa  256  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  33.63 
 
 
582 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 
576 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  34.6 
 
 
585 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 
599 aa  252  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
570 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 
574 aa  250  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
574 aa  247  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 
621 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
606 aa  246  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  28.93 
 
 
576 aa  230  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 
596 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 
548 aa  177  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  43.89 
 
 
705 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 
605 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  33.09 
 
 
325 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
651 aa  130  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.56 
 
 
598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.29 
 
 
607 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.17 
 
 
666 aa  127  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
773 aa  127  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  23.23 
 
 
667 aa  126  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  23.59 
 
 
700 aa  124  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.7 
 
 
632 aa  124  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.53 
 
 
658 aa  123  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
481 aa  123  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 
666 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 
531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 
517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
416 aa  122  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 
1415 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  38.1 
 
 
474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  35.58 
 
 
449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.37 
 
 
850 aa  118  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.43 
 
 
287 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  28.83 
 
 
662 aa  117  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.43 
 
 
553 aa  117  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.17 
 
 
667 aa  117  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  36.77 
 
 
421 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  34.69 
 
 
540 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
653 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
642 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  31.27 
 
 
658 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.07 
 
 
747 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.82 
 
 
584 aa  114  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
1479 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2732  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
563 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.420393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.11 
 
 
602 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  31.27 
 
 
481 aa  114  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  29.79 
 
 
692 aa  114  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.6 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  31.65 
 
 
259 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5885  protein serine/threonine phosphatase  35.84 
 
 
259 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  32.34 
 
 
441 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.57 
 
 
658 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  32.25 
 
 
614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  31.65 
 
 
259 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  30.08 
 
 
250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.5 
 
 
1044 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  29.86 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.43 
 
 
681 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
650 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>