More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5336 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  69.41 
 
 		 486 aa  663    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  71 
 
 		 479 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  69.98 
 
 		 478 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  70.51 
 
 		 479 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 485 aa  988    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  56.96 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  53.32 
 
 		 479 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  54.68 
 
 		 483 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  45.39 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  46.04 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  45.18 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  44.96 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  41.49 
 
 		 479 aa  342  7e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 		 481 aa  339  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  40.65 
 
 		 481 aa  339  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  38.97 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1751  serine/threonine protein kinase  42.29 
 
 		 214 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.868443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 		 691 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.73 
 
 		 584 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  28.83 
 
 		 692 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.31 
 
 		 650 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.86 
 
 		 715 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  30.72 
 
 		 533 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 862 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 		 468 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.47 
 
 		 798 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  30.69 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.68 
 
 		 641 aa  132  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  30.38 
 
 		 555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.68 
 
 		 863 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  30.54 
 
 		 556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  30.87 
 
 		 556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 651 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  30.41 
 
 		 529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  32.1 
 
 		 618 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.97 
 
 		 627 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 		 938 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 		 582 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 		 612 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 915 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.48 
 
 		 647 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 		 636 aa  127  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 1479 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.81 
 
 		 635 aa  126  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.96 
 
 		 822 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  32.57 
 
 		 1032 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  30.51 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.29 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  26.28 
 
 		 569 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 502 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 		 476 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.55 
 
 		 700 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.97 
 
 		 661 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 572 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  32.03 
 
 		 1032 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 615 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 746 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 		 783 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.94 
 
 		 676 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  31.14 
 
 		 625 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.43 
 
 		 666 aa  123  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 570 aa  123  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.82 
 
 		 668 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 		 556 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  31.14 
 
 		 625 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  31.62 
 
 		 1057 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.83 
 
 		 1023 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  30.55 
 
 		 1053 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.71 
 
 		 681 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.79 
 
 		 662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  29.26 
 
 		 579 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  32.31 
 
 		 1018 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 		 691 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 943 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  28.86 
 
 		 554 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 		 562 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.35 
 
 		 632 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 571 aa  120  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 		 605 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 624 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 624 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 624 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 		 502 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  28.72 
 
 		 556 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.2 
 
 		 613 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 		 683 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.89 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 610 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 574 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  30.07 
 
 		 617 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 		 647 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 557 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1234  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 539 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.54 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  28.41 
 
 		 621 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 703 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>