More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3479 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 		 580 aa  1203    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  52.12 
 
 		 574 aa  624  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 		 574 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  51.15 
 
 		 577 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  49.55 
 
 		 577 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  49.64 
 
 		 621 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  49.28 
 
 		 569 aa  558  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  48.03 
 
 		 579 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  47.26 
 
 		 569 aa  545  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  47.41 
 
 		 574 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  47.87 
 
 		 572 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  44.88 
 
 		 571 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  44.7 
 
 		 571 aa  485  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  44.6 
 
 		 585 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  40.85 
 
 		 596 aa  438  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  41.29 
 
 		 574 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  39.44 
 
 		 576 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  39.73 
 
 		 605 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 		 589 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 		 599 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  38.13 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  38.41 
 
 		 610 aa  405  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  39.15 
 
 		 596 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  37.97 
 
 		 590 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 		 606 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 		 586 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  36.92 
 
 		 591 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 		 548 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  30.72 
 
 		 571 aa  262  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  30.71 
 
 		 595 aa  256  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  30.04 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  29.1 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  29.18 
 
 		 554 aa  230  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  29.09 
 
 		 529 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  30.25 
 
 		 556 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  29.81 
 
 		 559 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  30.32 
 
 		 556 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  28.82 
 
 		 565 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  30.14 
 
 		 556 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  28.77 
 
 		 555 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  28.19 
 
 		 556 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  29.38 
 
 		 555 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  28.08 
 
 		 563 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  27.41 
 
 		 594 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  28.16 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  29.64 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 566 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  27.49 
 
 		 667 aa  198  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  27.16 
 
 		 580 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 573 aa  196  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 		 700 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  29.5 
 
 		 705 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.99 
 
 		 666 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.35 
 
 		 668 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.14 
 
 		 614 aa  126  8.000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.24 
 
 		 634 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  30.9 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  29.55 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.16 
 
 		 607 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  25.54 
 
 		 481 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.9 
 
 		 627 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.89 
 
 		 662 aa  117  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 776 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.32 
 
 		 715 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.51 
 
 		 445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  30.47 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.29 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 612 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.98 
 
 		 707 aa  115  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 593 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.43 
 
 		 916 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.18 
 
 		 1036 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  29.76 
 
 		 454 aa  114  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 		 673 aa  114  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  25.67 
 
 		 666 aa  113  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25 
 
 		 653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.6 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  31.75 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  28.88 
 
 		 736 aa  112  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 		 466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6663  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 		 414 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.997468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  30.89 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.7 
 
 		 517 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.42 
 
 		 850 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.13 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 469 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 		 517 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 710 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.3 
 
 		 657 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  29.3 
 
 		 583 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 		 666 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  30.18 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 		 690 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  29.48 
 
 		 989 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  30.63 
 
 		 625 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>