More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1782 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  73.74 
 
 
556 aa  806    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  74.67 
 
 
556 aa  816    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  72.23 
 
 
529 aa  777    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  72.81 
 
 
553 aa  787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
556 aa  1107    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  71.08 
 
 
559 aa  757    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  74.49 
 
 
555 aa  816    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  73.93 
 
 
556 aa  808    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  69.2 
 
 
554 aa  728    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  70.34 
 
 
555 aa  730    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  69.65 
 
 
533 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  45.73 
 
 
565 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  43.77 
 
 
562 aa  428  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  39.93 
 
 
582 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  39.65 
 
 
566 aa  337  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 
573 aa  333  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  37.39 
 
 
594 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  37.37 
 
 
580 aa  322  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  38.17 
 
 
595 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
570 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  36.46 
 
 
563 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 
574 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  34.38 
 
 
571 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
574 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 
577 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 
577 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 
571 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  33.15 
 
 
571 aa  263  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 
574 aa  260  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 
569 aa  259  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
585 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  31.59 
 
 
572 aa  256  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  28.6 
 
 
596 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
589 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  31.52 
 
 
591 aa  243  9e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  28.49 
 
 
569 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 
574 aa  239  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
610 aa  234  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
586 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  29.25 
 
 
590 aa  233  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  28.27 
 
 
580 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
599 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  28.5 
 
 
576 aa  230  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  31.84 
 
 
579 aa  230  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
621 aa  226  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
606 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  27.43 
 
 
596 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
576 aa  220  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  49.02 
 
 
705 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
548 aa  182  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 
605 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 
700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  25.6 
 
 
667 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
761 aa  124  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.86 
 
 
747 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  27.7 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
483 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
598 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25.27 
 
 
666 aa  113  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.05 
 
 
627 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.68 
 
 
614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  30.63 
 
 
790 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
486 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
479 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 
421 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.48 
 
 
863 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
479 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.33 
 
 
634 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
1479 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.28 
 
 
850 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
479 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.14 
 
 
667 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
651 aa  108  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 
1415 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  30.48 
 
 
469 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.34 
 
 
668 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.81 
 
 
603 aa  106  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  26.38 
 
 
692 aa  106  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
479 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  30.56 
 
 
352 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  27.69 
 
 
325 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.67 
 
 
632 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.62 
 
 
728 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.5 
 
 
406 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.68 
 
 
662 aa  104  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.34 
 
 
1110 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.79 
 
 
658 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.84 
 
 
641 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  33.92 
 
 
581 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.5 
 
 
642 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.33 
 
 
653 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
481 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  29.33 
 
 
666 aa  101  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
646 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.66 
 
 
662 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
982 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>