More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1132 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  57.27 
 
 
572 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  59.3 
 
 
577 aa  661    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  66.61 
 
 
585 aa  696    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  100 
 
 
571 aa  1140    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  98.25 
 
 
571 aa  1129    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  55.61 
 
 
577 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  52.11 
 
 
574 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  55.81 
 
 
574 aa  624  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  55.36 
 
 
621 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  47.91 
 
 
574 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  50.36 
 
 
569 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  48.74 
 
 
569 aa  535  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  51.77 
 
 
579 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  43.96 
 
 
580 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  40.86 
 
 
574 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  38.72 
 
 
596 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 
606 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  37.94 
 
 
576 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  37.57 
 
 
576 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 
570 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  37.09 
 
 
590 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 
596 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 
589 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 
586 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  37.79 
 
 
599 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 
610 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  37.06 
 
 
591 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  36.24 
 
 
605 aa  356  5e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  32.66 
 
 
548 aa  279  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  33.75 
 
 
595 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  34.62 
 
 
563 aa  269  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  33.39 
 
 
556 aa  267  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  32.55 
 
 
571 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  32.91 
 
 
556 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  32.73 
 
 
556 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  32.25 
 
 
555 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  33.09 
 
 
555 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  32.07 
 
 
556 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  30.42 
 
 
553 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  31.46 
 
 
554 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  32.7 
 
 
565 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  31.05 
 
 
529 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  33.08 
 
 
533 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  31.82 
 
 
559 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  33.04 
 
 
562 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  30.68 
 
 
594 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  31.38 
 
 
582 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 
573 aa  211  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  30.72 
 
 
580 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  26.78 
 
 
667 aa  195  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  24.74 
 
 
700 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.92 
 
 
666 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  41.38 
 
 
705 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  29.15 
 
 
614 aa  134  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
636 aa  131  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  28.96 
 
 
662 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.63 
 
 
627 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 
328 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  33.59 
 
 
586 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  29.01 
 
 
634 aa  130  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  30.1 
 
 
472 aa  127  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 
479 aa  127  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  27.52 
 
 
664 aa  127  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  27.52 
 
 
664 aa  127  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 
479 aa  126  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.69 
 
 
598 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.19 
 
 
641 aa  125  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 
466 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.82 
 
 
668 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.56 
 
 
692 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 
469 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  28.52 
 
 
481 aa  124  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 
666 aa  123  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
517 aa  123  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 
691 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  37.44 
 
 
502 aa  123  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  35.32 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
439 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.77 
 
 
850 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 
625 aa  121  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  27.55 
 
 
485 aa  120  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.85 
 
 
650 aa  120  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
1415 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  31.69 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
646 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
938 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  27.78 
 
 
641 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 
703 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 
658 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.23 
 
 
667 aa  118  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.52 
 
 
666 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  28.08 
 
 
625 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.99 
 
 
551 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
757 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  34.93 
 
 
586 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.54 
 
 
653 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  29.59 
 
 
465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>