More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3713 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  100 
 
 		 591 aa  1224    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  45.97 
 
 		 589 aa  537  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  46.71 
 
 		 590 aa  528  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  41.4 
 
 		 610 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  40.28 
 
 		 570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 		 574 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  40.31 
 
 		 621 aa  405  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  37.07 
 
 		 580 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  37.99 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  37.02 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  36.69 
 
 		 606 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 		 596 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 		 574 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  35.65 
 
 		 569 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 		 599 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  36.67 
 
 		 579 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 		 571 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 		 596 aa  362  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 		 572 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  37.06 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 		 577 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  35.02 
 
 		 586 aa  358  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 574 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 		 585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  34.49 
 
 		 574 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  34.7 
 
 		 576 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  32.93 
 
 		 576 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  32.25 
 
 		 605 aa  300  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  31.17 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  30.55 
 
 		 595 aa  261  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  32.81 
 
 		 553 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  32.04 
 
 		 555 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  31.99 
 
 		 556 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  31.82 
 
 		 556 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  32.39 
 
 		 556 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  31.46 
 
 		 556 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  31.29 
 
 		 529 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  31.4 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  30.28 
 
 		 562 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  29.74 
 
 		 565 aa  231  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  30.63 
 
 		 559 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  31.04 
 
 		 555 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  30.58 
 
 		 563 aa  227  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 566 aa  223  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  28.6 
 
 		 573 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  28.95 
 
 		 667 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  30.45 
 
 		 533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 		 700 aa  212  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  27.93 
 
 		 594 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  28.96 
 
 		 582 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  26.07 
 
 		 580 aa  196  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  28.27 
 
 		 705 aa  125  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  26.1 
 
 		 325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.3 
 
 		 614 aa  117  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.26 
 
 		 715 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 		 481 aa  114  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 666 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.96 
 
 		 627 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  27.36 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 		 703 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.5 
 
 		 598 aa  107  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.81 
 
 		 666 aa  107  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  26.38 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  32.52 
 
 		 276 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  30.23 
 
 		 271 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  25.53 
 
 		 625 aa  104  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.05 
 
 		 681 aa  104  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 		 628 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  26.33 
 
 		 672 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  26.59 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  28.22 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.39 
 
 		 653 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  29.04 
 
 		 256 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 		 625 aa  102  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 612 aa  101  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  26.41 
 
 		 454 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.99 
 
 		 551 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 		 646 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1908  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.99 
 
 		 655 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182347  hitchhiker  0.00089522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  28.46 
 
 		 270 aa  100  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  27.51 
 
 		 593 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  26.87 
 
 		 736 aa  99.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.6 
 
 		 863 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 776 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.85 
 
 		 746 aa  98.6  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  26.22 
 
 		 586 aa  98.6  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  28.16 
 
 		 667 aa  98.6  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 612 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 		 690 aa  97.8  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.99 
 
 		 607 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 328 aa  98.2  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  28.05 
 
 		 465 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  26.12 
 
 		 254 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 		 455 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  25.42 
 
 		 661 aa  97.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.91 
 
 		 553 aa  97.4  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>