More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2762 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  54.55 
 
 		 596 aa  663    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 606 aa  1253    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  70.67 
 
 		 599 aa  854    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  59.02 
 
 		 596 aa  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  41.9 
 
 		 574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 		 586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  40.03 
 
 		 621 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  37.56 
 
 		 576 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 		 574 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 		 576 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 		 569 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 589 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  38.22 
 
 		 571 aa  415  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 		 577 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  37.26 
 
 		 569 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  35.88 
 
 		 580 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  37.95 
 
 		 579 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 		 570 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 		 574 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  34.95 
 
 		 590 aa  388  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 		 574 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  36.44 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  36.69 
 
 		 591 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 		 610 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 		 548 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 605 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  30.52 
 
 		 563 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  27.68 
 
 		 562 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  30.26 
 
 		 571 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  29.57 
 
 		 555 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  29.81 
 
 		 559 aa  249  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  30.2 
 
 		 529 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  29.24 
 
 		 565 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  29.29 
 
 		 595 aa  248  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  28.42 
 
 		 553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  28.9 
 
 		 556 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  28.9 
 
 		 556 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  29.47 
 
 		 555 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  28.82 
 
 		 554 aa  239  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  28.55 
 
 		 556 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  30.46 
 
 		 533 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  26.48 
 
 		 556 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 		 566 aa  217  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  27.96 
 
 		 594 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  27.69 
 
 		 582 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 		 573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  27.7 
 
 		 667 aa  189  9e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  26.15 
 
 		 580 aa  181  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 		 700 aa  170  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  31.76 
 
 		 705 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.46 
 
 		 598 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 		 666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  31.4 
 
 		 325 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  30.23 
 
 		 593 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 625 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  30.47 
 
 		 638 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.23 
 
 		 591 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  30.68 
 
 		 614 aa  127  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 		 776 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  29.37 
 
 		 620 aa  124  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 673 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.21 
 
 		 666 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  30 
 
 		 662 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.53 
 
 		 1044 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.72 
 
 		 650 aa  121  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.51 
 
 		 658 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.94 
 
 		 445 aa  120  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 		 612 aa  120  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 651 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 		 468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.58 
 
 		 715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  31.82 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.62 
 
 		 647 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  31.36 
 
 		 436 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.9 
 
 		 553 aa  118  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  31.15 
 
 		 586 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.18 
 
 		 602 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.92 
 
 		 653 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.89 
 
 		 668 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 565 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 483 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  29.3 
 
 		 692 aa  116  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  30.88 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  30.41 
 
 		 431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.41 
 
 		 707 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 		 628 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  29.54 
 
 		 623 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.57 
 
 		 907 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.54 
 
 		 579 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 		 469 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  26.52 
 
 		 465 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 		 466 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 328 aa  114  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 		 466 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>