More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2097 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  70.2 
 
 		 556 aa  742    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  67.55 
 
 		 529 aa  705    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  100 
 
 		 554 aa  1099    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  67.97 
 
 		 553 aa  714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  69.27 
 
 		 556 aa  742    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  70.58 
 
 		 556 aa  745    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  70.23 
 
 		 533 aa  686    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  74.54 
 
 		 559 aa  776    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  71.64 
 
 		 555 aa  730    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  69.65 
 
 		 556 aa  738    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  70.39 
 
 		 555 aa  746    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  46.26 
 
 		 565 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  45.99 
 
 		 562 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  41.79 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  42.43 
 
 		 582 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  41.06 
 
 		 566 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  40.88 
 
 		 580 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  40.6 
 
 		 573 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  41.98 
 
 		 595 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  38.04 
 
 		 563 aa  320  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  36.65 
 
 		 571 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  31.83 
 
 		 574 aa  301  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 570 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 		 574 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 		 577 aa  279  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 596 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 		 571 aa  263  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  30.86 
 
 		 590 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 585 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  31.27 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 		 569 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 589 aa  256  6e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 		 572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 		 576 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 610 aa  251  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 599 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 		 621 aa  249  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  31.75 
 
 		 591 aa  248  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  29.24 
 
 		 580 aa  247  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 		 606 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  28.75 
 
 		 569 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 		 574 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  51.37 
 
 		 705 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  32.92 
 
 		 579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 		 605 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  24.44 
 
 		 667 aa  144  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 700 aa  134  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.98 
 
 		 598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.22 
 
 		 863 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.82 
 
 		 747 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.11 
 
 		 528 aa  121  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 		 485 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  30.6 
 
 		 620 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.06 
 
 		 668 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.97 
 
 		 627 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  32.8 
 
 		 692 aa  117  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.6 
 
 		 658 aa  116  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 		 628 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 		 479 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 		 502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  25.86 
 
 		 761 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  28.96 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  28.85 
 
 		 325 aa  114  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 593 aa  113  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  34.81 
 
 		 614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 651 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 703 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.12 
 
 		 584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  36.14 
 
 		 672 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.22 
 
 		 667 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  28.41 
 
 		 623 aa  110  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  36.74 
 
 		 562 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.28 
 
 		 661 aa  110  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  30.71 
 
 		 617 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6663  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 414 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.997468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.22 
 
 		 681 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  32.82 
 
 		 790 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 783 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.86 
 
 		 632 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  27 
 
 		 651 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  31.89 
 
 		 1415 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 		 636 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  26.3 
 
 		 638 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.78 
 
 		 641 aa  109  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.69 
 
 		 653 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 		 1479 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>