More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1814 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  54.42 
 
 
606 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  54.78 
 
 
596 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
596 aa  1237    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  51.11 
 
 
599 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  42.48 
 
 
574 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 
574 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  39.73 
 
 
576 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  39.24 
 
 
586 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 
576 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  40.57 
 
 
569 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  39.25 
 
 
571 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  39.3 
 
 
570 aa  425  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
577 aa  425  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  39.36 
 
 
621 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  38.72 
 
 
571 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  37.88 
 
 
569 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  39.1 
 
 
580 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 
577 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
574 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  36.32 
 
 
572 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  37.83 
 
 
574 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 
610 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
585 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  37.5 
 
 
579 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 
589 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  34.93 
 
 
590 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  36.05 
 
 
591 aa  362  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
548 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  29.47 
 
 
559 aa  254  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
605 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  29.58 
 
 
553 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  29.8 
 
 
529 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  29.03 
 
 
562 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  28.9 
 
 
556 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  29.43 
 
 
556 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  29.06 
 
 
556 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  28.6 
 
 
555 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  29.79 
 
 
555 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  28.47 
 
 
571 aa  236  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  29.21 
 
 
565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  28.5 
 
 
554 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  28.01 
 
 
563 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  29.05 
 
 
533 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  27.4 
 
 
556 aa  223  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  27.19 
 
 
595 aa  220  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 
566 aa  214  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  29.27 
 
 
582 aa  209  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  27.49 
 
 
594 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 
573 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  25.7 
 
 
580 aa  191  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  27.16 
 
 
667 aa  189  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  26 
 
 
700 aa  179  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  31.75 
 
 
705 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.46 
 
 
598 aa  143  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.47 
 
 
627 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 
625 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  30 
 
 
662 aa  127  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.93 
 
 
593 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 
666 aa  124  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.37 
 
 
607 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  31.58 
 
 
403 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.15 
 
 
591 aa  122  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.42 
 
 
650 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.8 
 
 
653 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.37 
 
 
661 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
646 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 
646 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 
651 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  29.2 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  28.03 
 
 
672 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 
628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
580 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
439 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.78 
 
 
647 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  29.31 
 
 
623 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.39 
 
 
668 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.8 
 
 
728 aa  114  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.8 
 
 
707 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  27.94 
 
 
658 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  27.13 
 
 
325 aa  114  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
757 aa  114  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 
642 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.8 
 
 
602 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  38.51 
 
 
569 aa  113  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.62 
 
 
715 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  31.73 
 
 
666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  28.22 
 
 
623 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 
761 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.04 
 
 
406 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  29.2 
 
 
638 aa  112  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
565 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
398 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  30.92 
 
 
614 aa  111  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
398 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 
612 aa  111  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  32.62 
 
 
399 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.31 
 
 
681 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
398 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>