More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4949 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
610 aa  1266    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  43.66 
 
 
570 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  44.97 
 
 
589 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  41.27 
 
 
590 aa  480  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  42.12 
 
 
591 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 
621 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 
574 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  38.41 
 
 
580 aa  412  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  38.51 
 
 
577 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 
596 aa  405  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 
569 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
596 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  37.8 
 
 
569 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 
599 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 
574 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  36.95 
 
 
571 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  36.95 
 
 
571 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 
606 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 
574 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
574 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
585 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  35.91 
 
 
579 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 
577 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  36.83 
 
 
572 aa  359  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  33.96 
 
 
576 aa  350  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 
576 aa  349  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 
586 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
605 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 
566 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  31.41 
 
 
595 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 
556 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  30.39 
 
 
554 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  29.51 
 
 
556 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  29.86 
 
 
556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  30.04 
 
 
556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  29.69 
 
 
580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 
573 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  29.09 
 
 
562 aa  239  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  29.68 
 
 
553 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  27.76 
 
 
571 aa  238  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  28.74 
 
 
565 aa  236  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  29.95 
 
 
594 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  29.15 
 
 
555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  29.93 
 
 
559 aa  234  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  28.73 
 
 
529 aa  230  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 
548 aa  228  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  30.7 
 
 
582 aa  223  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  29.7 
 
 
555 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  28.89 
 
 
563 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  28.86 
 
 
533 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  26.47 
 
 
667 aa  182  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 
700 aa  177  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  30.54 
 
 
705 aa  144  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
479 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
479 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  28.9 
 
 
325 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  31.14 
 
 
662 aa  124  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.41 
 
 
668 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
478 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  26.51 
 
 
481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  29.23 
 
 
634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.46 
 
 
666 aa  115  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 
466 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  27.21 
 
 
466 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.67 
 
 
653 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.62 
 
 
627 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.27 
 
 
715 aa  112  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.73 
 
 
607 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.04 
 
 
850 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 
486 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  30.29 
 
 
641 aa  110  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 
502 aa  110  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.61 
 
 
863 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  31.05 
 
 
469 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  25.86 
 
 
465 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.42 
 
 
657 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.19 
 
 
652 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.01 
 
 
614 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  25.08 
 
 
657 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
657 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  29.86 
 
 
625 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 
666 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  25.42 
 
 
656 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
657 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  26.79 
 
 
618 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
479 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
657 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
657 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
657 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
657 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
657 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  28.06 
 
 
625 aa  107  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 
328 aa  107  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
657 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.07 
 
 
528 aa  107  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.57 
 
 
598 aa  107  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
580 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>