More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2101 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  68.9 
 
 
556 aa  749    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  69.46 
 
 
556 aa  752    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  89.22 
 
 
529 aa  961    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  71 
 
 
559 aa  751    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  100 
 
 
553 aa  1113    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  72.81 
 
 
556 aa  786    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  69.4 
 
 
555 aa  750    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  67.9 
 
 
554 aa  699    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  67.16 
 
 
555 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  67.12 
 
 
533 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  69.09 
 
 
556 aa  749    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  44.13 
 
 
565 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  42.31 
 
 
562 aa  418  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 
573 aa  335  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  39.12 
 
 
566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  38.92 
 
 
582 aa  323  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  37.44 
 
 
594 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  36.03 
 
 
580 aa  302  9e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  36.33 
 
 
595 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  36.01 
 
 
563 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
574 aa  286  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
570 aa  280  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  33.82 
 
 
571 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
574 aa  278  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 
572 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
577 aa  266  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
596 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
574 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  32.87 
 
 
591 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 
577 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
599 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 
571 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  29.9 
 
 
590 aa  247  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 
596 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  30.29 
 
 
571 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 
589 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
606 aa  243  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 
585 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  29.06 
 
 
580 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
621 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 
569 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  29.6 
 
 
576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 
574 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 
586 aa  233  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  30.78 
 
 
576 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  28.37 
 
 
569 aa  230  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
610 aa  230  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  30.93 
 
 
579 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  48.28 
 
 
705 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  28.6 
 
 
548 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  24.96 
 
 
605 aa  163  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  25.68 
 
 
667 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 
700 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
485 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
483 aa  124  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
761 aa  119  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  28.04 
 
 
465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 
486 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  33.46 
 
 
790 aa  116  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.51 
 
 
594 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  34.08 
 
 
325 aa  114  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.17 
 
 
658 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  29.97 
 
 
479 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  35.8 
 
 
662 aa  113  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  34.92 
 
 
618 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.57 
 
 
747 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.24 
 
 
598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.67 
 
 
613 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 
479 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  35.11 
 
 
625 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  31.44 
 
 
692 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 
615 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
625 aa  110  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.01 
 
 
601 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
666 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.68 
 
 
627 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 
691 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.05 
 
 
666 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  33.33 
 
 
869 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
466 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
481 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.5 
 
 
1110 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  34.74 
 
 
352 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  32.62 
 
 
614 aa  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.75 
 
 
681 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
657 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.16 
 
 
579 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
466 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  26.79 
 
 
457 aa  107  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
479 aa  106  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 
479 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
479 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
603 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
651 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.3 
 
 
668 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 
468 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.52 
 
 
715 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 
582 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 
626 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0993188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>