More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1867 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  87.39 
 
 		 486 aa  806    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  82.21 
 
 		 478 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  71 
 
 		 485 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  86.22 
 
 		 479 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 479 aa  969    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  57.11 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  52.85 
 
 		 483 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  54.03 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  45.73 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  45.59 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  45.3 
 
 		 466 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  45.08 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  40.42 
 
 		 481 aa  335  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  39.79 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  38.21 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  39.53 
 
 		 481 aa  326  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 		 479 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1751  serine/threonine protein kinase  39.8 
 
 		 214 aa  172  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.868443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  31.38 
 
 		 555 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  32.12 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  30.34 
 
 		 533 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  32.29 
 
 		 556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  32.76 
 
 		 554 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.6 
 
 		 863 aa  133  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  32.29 
 
 		 555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.92 
 
 		 650 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  31.94 
 
 		 556 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  31.06 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 		 556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  28.52 
 
 		 692 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.26 
 
 		 715 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 		 574 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 691 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 		 783 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 862 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  33.94 
 
 		 580 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.99 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 502 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.69 
 
 		 822 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 		 938 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 557 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  33.21 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.83 
 
 		 746 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.23 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 		 651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  30.18 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.83 
 
 		 880 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  30.41 
 
 		 562 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 		 612 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 		 468 aa  120  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  28.47 
 
 		 569 aa  120  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.23 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 		 647 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  30.17 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 		 572 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 		 683 aa  119  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.56 
 
 		 747 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.43 
 
 		 641 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 577 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 		 1479 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  32.35 
 
 		 595 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.75 
 
 		 798 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 		 566 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  34.6 
 
 		 593 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.16 
 
 		 769 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 703 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  30.58 
 
 		 1053 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 		 915 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.86 
 
 		 627 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 		 678 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  29 
 
 		 610 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.76 
 
 		 757 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.05 
 
 		 1023 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  28.32 
 
 		 579 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.38 
 
 		 645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.3 
 
 		 943 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  30.51 
 
 		 1057 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.04 
 
 		 627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  26.33 
 
 		 606 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  32.59 
 
 		 889 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  29 
 
 		 636 aa  114  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 		 605 aa  113  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.87 
 
 		 666 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.18 
 
 		 520 aa  114  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  29.21 
 
 		 559 aa  114  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.41 
 
 		 635 aa  113  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.17 
 
 		 632 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 		 662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  29.25 
 
 		 594 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.08 
 
 		 647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.04 
 
 		 614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 		 615 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 		 596 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>