More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0336 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
777 aa  1545    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  69 
 
 
771 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  68.63 
 
 
774 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  62.36 
 
 
752 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  61.23 
 
 
762 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  53.55 
 
 
622 aa  286  9e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  49.64 
 
 
587 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0061  hypothetical protein  79.22 
 
 
154 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.816015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  40.95 
 
 
357 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0235  serine/threonine protein kinase  47.47 
 
 
415 aa  234  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  44.33 
 
 
602 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  40.28 
 
 
457 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  42.81 
 
 
457 aa  207  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 
621 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  40.07 
 
 
653 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
652 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  38.41 
 
 
437 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 
687 aa  180  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  42.32 
 
 
861 aa  179  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  39.31 
 
 
475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  39.79 
 
 
485 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  39.18 
 
 
490 aa  170  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  38.43 
 
 
502 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  36.44 
 
 
642 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 
774 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  38.43 
 
 
505 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  35.45 
 
 
638 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.22 
 
 
666 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.36 
 
 
584 aa  162  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  36.52 
 
 
500 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 
646 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  34.06 
 
 
593 aa  157  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
615 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  33.95 
 
 
604 aa  156  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.2 
 
 
662 aa  155  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
666 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.67 
 
 
647 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.2 
 
 
650 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
612 aa  152  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.25 
 
 
602 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  35.9 
 
 
461 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.56 
 
 
579 aa  151  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 
599 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  36.4 
 
 
618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.7 
 
 
668 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  36 
 
 
486 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  31.73 
 
 
664 aa  148  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  33.7 
 
 
662 aa  148  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  31.73 
 
 
664 aa  148  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
691 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  30.66 
 
 
692 aa  147  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 
557 aa  147  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
628 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.78 
 
 
591 aa  146  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 
651 aa  145  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.42 
 
 
658 aa  146  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.83 
 
 
406 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33 
 
 
653 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 
646 aa  145  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  31.88 
 
 
614 aa  145  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.51 
 
 
598 aa  145  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 
612 aa  145  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.92 
 
 
594 aa  144  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 
891 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 
1479 aa  144  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.56 
 
 
601 aa  144  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  37.37 
 
 
609 aa  144  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0229  serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 
353 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0240  serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 
353 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0217  serine/threonine protein kinase  36.98 
 
 
353 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00807707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
551 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
632 aa  143  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.74 
 
 
645 aa  142  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.36 
 
 
880 aa  142  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.37 
 
 
603 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
596 aa  141  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.86 
 
 
850 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
642 aa  141  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 
938 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
691 aa  141  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  38.44 
 
 
894 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  36.6 
 
 
450 aa  140  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  35.94 
 
 
623 aa  140  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
1198 aa  140  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.52 
 
 
520 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
746 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.97 
 
 
869 aa  140  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
703 aa  140  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.45 
 
 
668 aa  140  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
651 aa  139  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.39 
 
 
627 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 
985 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.63 
 
 
664 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.69 
 
 
667 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
615 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  34.42 
 
 
620 aa  139  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.73 
 
 
627 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.09 
 
 
676 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  36.16 
 
 
403 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.553503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>