More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3944 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3944  Serine/threonine protein kinase-like  100 
 
 
700 aa  1428    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.147415  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  33.33 
 
 
666 aa  182  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 
1435 aa  181  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
1415 aa  178  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  37.99 
 
 
1479 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  35.9 
 
 
625 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  35.53 
 
 
625 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
537 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.19 
 
 
1373 aa  174  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  34.07 
 
 
626 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  35.14 
 
 
664 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  35.14 
 
 
664 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1473  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.7 
 
 
747 aa  171  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0818047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 
632 aa  171  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
624 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 
666 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  31.11 
 
 
638 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
624 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
624 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.07 
 
 
645 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.51 
 
 
700 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  32.62 
 
 
615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  32.84 
 
 
604 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  34.18 
 
 
666 aa  167  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.58 
 
 
520 aa  168  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.97 
 
 
715 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.58 
 
 
664 aa  167  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  32.59 
 
 
758 aa  167  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.71 
 
 
650 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.07 
 
 
676 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  34.08 
 
 
662 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.71 
 
 
863 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.99 
 
 
653 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.81 
 
 
627 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.84 
 
 
602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 
651 aa  165  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
707 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 
700 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0122  serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 
592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.45 
 
 
681 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.6 
 
 
646 aa  164  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.25 
 
 
681 aa  164  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 
642 aa  164  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.73 
 
 
647 aa  163  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.8 
 
 
661 aa  163  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  34.18 
 
 
625 aa  163  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
513 aa  163  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 
761 aa  163  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.36 
 
 
627 aa  163  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
565 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.22 
 
 
641 aa  162  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33 
 
 
1607 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 
673 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 
588 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
450 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
598 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 
703 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  36.5 
 
 
1057 aa  161  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 
613 aa  161  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
646 aa  161  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
593 aa  161  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.47 
 
 
579 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  31.72 
 
 
614 aa  160  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  33.58 
 
 
620 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  31 
 
 
776 aa  160  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4508  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
403 aa  160  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  32.25 
 
 
668 aa  160  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  34.32 
 
 
1032 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.82 
 
 
1044 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.63 
 
 
503 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2186  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.95 
 
 
610 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  30.36 
 
 
519 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
328 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
710 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.71 
 
 
607 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  31.21 
 
 
623 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.71 
 
 
517 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  35.34 
 
 
1053 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4246  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
623 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35051  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.26 
 
 
652 aa  159  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.74 
 
 
668 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  34.32 
 
 
1032 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4221  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
623 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.51 
 
 
635 aa  159  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  34.89 
 
 
721 aa  158  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 
573 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
590 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  37.36 
 
 
618 aa  158  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
651 aa  158  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 
625 aa  158  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.44 
 
 
740 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
723 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
596 aa  157  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  32.86 
 
 
641 aa  157  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 
653 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  34.43 
 
 
692 aa  157  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  32.83 
 
 
574 aa  157  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.21 
 
 
667 aa  157  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  33.7 
 
 
634 aa  157  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.45 
 
 
632 aa  157  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>