More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05610  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
693 aa  1374    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.850356  normal  0.365615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0458  serine/threonine protein kinase  70.13 
 
 
605 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2199  serine/threonine protein kinase  57.99 
 
 
522 aa  419  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0725678  hitchhiker  0.00985459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0491  serine/threonine protein kinase  55.71 
 
 
568 aa  349  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0764361  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21540  serine/threonine protein kinase  55.35 
 
 
553 aa  336  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1757  serine/threonine protein kinase  54.89 
 
 
510 aa  333  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07550  serine/threonine protein kinase  54.35 
 
 
568 aa  328  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0745777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1294  serine/threonine protein kinase  52.29 
 
 
581 aa  314  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1338  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 
602 aa  313  6.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000158737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1327  serine/threonine protein kinase  50.43 
 
 
536 aa  290  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0293261  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2211  serine/threonine protein kinase  45.97 
 
 
475 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529503  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0956  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 
473 aa  227  7e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  39.48 
 
 
1009 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1846  serine/threonine protein kinase  40.36 
 
 
558 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  39.48 
 
 
1009 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  39.48 
 
 
1017 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  40.22 
 
 
1110 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  34.36 
 
 
993 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.7 
 
 
584 aa  156  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3960  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.32 
 
 
550 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6706  serine/threonine protein kinase  38.29 
 
 
664 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0848687  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  39.29 
 
 
519 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6482  serine/threonine protein kinase  39.31 
 
 
591 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  36.23 
 
 
494 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.35 
 
 
650 aa  144  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  33.57 
 
 
692 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 
703 aa  140  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.86 
 
 
757 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
691 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  37 
 
 
666 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 
641 aa  138  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
729 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.23 
 
 
598 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.95 
 
 
652 aa  137  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.27 
 
 
880 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.35 
 
 
715 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  37.74 
 
 
621 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.44 
 
 
632 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  36.13 
 
 
620 aa  135  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  35.93 
 
 
604 aa  134  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.28 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 
563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.3 
 
 
863 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
381 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.18 
 
 
1072 aa  130  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 
612 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.18 
 
 
1072 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
612 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 
894 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  35.04 
 
 
989 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
773 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4231  cyclic nucleotide-binding protein  34.84 
 
 
444 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.07 
 
 
681 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
657 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
657 aa  129  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
996 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 
615 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.82 
 
 
627 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3039  serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
735 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
657 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  36.7 
 
 
889 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
657 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 
628 aa  127  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.47 
 
 
657 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.93 
 
 
557 aa  126  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  43.14 
 
 
719 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5621  serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 
845 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205775  normal  0.427226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 
497 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
673 aa  125  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  34.09 
 
 
656 aa  125  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.02 
 
 
1076 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
627 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4344  protein kinase  33.46 
 
 
504 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927166  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.35 
 
 
602 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 
776 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 
585 aa  124  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  39.25 
 
 
589 aa  124  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.69 
 
 
531 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  36.92 
 
 
758 aa  124  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
430 aa  124  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
430 aa  124  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.99 
 
 
528 aa  124  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
431 aa  124  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4785  serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
395 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
480 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
671 aa  123  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 
468 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.96 
 
 
662 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  36.69 
 
 
451 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.74 
 
 
593 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 
770 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.58 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.59 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>