More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07550  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
568 aa  1133    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0745777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0491  serine/threonine protein kinase  60.19 
 
 
568 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0764361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1294  serine/threonine protein kinase  55.27 
 
 
581 aa  346  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1338  serine/threonine protein kinase  54.95 
 
 
602 aa  346  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000158737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2199  serine/threonine protein kinase  57 
 
 
522 aa  331  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0725678  hitchhiker  0.00985459 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21540  serine/threonine protein kinase  59.14 
 
 
553 aa  329  7e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1757  serine/threonine protein kinase  55.67 
 
 
510 aa  319  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0458  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 
605 aa  317  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05610  serine/threonine protein kinase  55.48 
 
 
693 aa  317  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.850356  normal  0.365615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1327  serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 
536 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0293261  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2211  serine/threonine protein kinase  43.97 
 
 
475 aa  250  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529503  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0956  serine/threonine protein kinase  41.33 
 
 
473 aa  209  8e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1846  serine/threonine protein kinase  41.16 
 
 
558 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  39.06 
 
 
1017 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  39.06 
 
 
1009 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  39.06 
 
 
1009 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  38.43 
 
 
993 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  37.32 
 
 
1110 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6706  serine/threonine protein kinase  39.63 
 
 
664 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0848687  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  40.23 
 
 
494 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.39 
 
 
584 aa  151  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.95 
 
 
715 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
519 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.09 
 
 
579 aa  145  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.33 
 
 
598 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.53 
 
 
880 aa  143  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.3 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  37.02 
 
 
621 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.23 
 
 
943 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.54 
 
 
632 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.79 
 
 
650 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3960  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.83 
 
 
550 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
938 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  35.69 
 
 
889 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 
703 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  37 
 
 
612 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.56 
 
 
798 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4344  protein kinase  34.81 
 
 
504 aa  136  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927166  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.26 
 
 
662 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  35.93 
 
 
625 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  31.03 
 
 
692 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4009  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.46 
 
 
459 aa  135  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.53 
 
 
1023 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
691 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  36.6 
 
 
623 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4785  serine/threonine protein kinase  35 
 
 
395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 
455 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  34.6 
 
 
576 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  34.73 
 
 
662 aa  134  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  34.6 
 
 
576 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.96 
 
 
593 aa  134  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  35.66 
 
 
604 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
651 aa  133  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
891 aa  133  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.94 
 
 
822 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 
671 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.5 
 
 
557 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.96 
 
 
591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  30.22 
 
 
638 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
776 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6482  serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 
591 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.93 
 
 
641 aa  130  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
666 aa  130  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
770 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.46 
 
 
653 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.58 
 
 
668 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.8 
 
 
518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.16 
 
 
647 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  32.83 
 
 
634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  33.66 
 
 
618 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
673 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  36.36 
 
 
618 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
915 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  33.68 
 
 
692 aa  127  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
641 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
349 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
530 aa  127  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.82 
 
 
635 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.47 
 
 
602 aa  126  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 
996 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
888 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5558  protein kinase  32.74 
 
 
518 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.759172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
989 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 
624 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.94 
 
 
627 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 
624 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 
624 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.13 
 
 
645 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
721 aa  125  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  34.72 
 
 
467 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.22 
 
 
477 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
650 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  33.21 
 
 
626 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.49 
 
 
553 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.29 
 
 
676 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>