More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4231 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4231  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 444 aa  905    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0154  serine/threonine-protein kinase  72.27 
 
 		 447 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1432  cyclic nucleotide-binding protein  38.69 
 
 		 431 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1722  cyclic nucleotide-binding protein  38.57 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.107588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  39.58 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  35.31 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  35.79 
 
 		 869 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  39.18 
 
 		 907 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  37.67 
 
 		 625 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  38.59 
 
 		 624 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  38.59 
 
 		 624 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  38.59 
 
 		 624 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  35.05 
 
 		 634 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 		 700 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  35.91 
 
 		 825 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  36.8 
 
 		 620 aa  167  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1729  serine/threonine protein kinase  39.11 
 
 		 301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.372145  normal  0.952904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  35.33 
 
 		 618 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  36.21 
 
 		 626 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 691 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  34.03 
 
 		 820 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  37.74 
 
 		 628 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  37 
 
 		 625 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.88 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.59 
 
 		 650 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.04 
 
 		 594 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.36 
 
 		 645 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.19 
 
 		 668 aa  159  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.56 
 
 		 601 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.53 
 
 		 693 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  35.14 
 
 		 736 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.06 
 
 		 681 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.43 
 
 		 584 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 		 615 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 666 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  36.47 
 
 		 621 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 		 866 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.87 
 
 		 627 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  34.11 
 
 		 668 aa  153  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 		 573 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  35.02 
 
 		 597 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  34.89 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  34.78 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  35.59 
 
 		 1053 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.85 
 
 		 613 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.83 
 
 		 653 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  33.82 
 
 		 641 aa  150  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 		 582 aa  150  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  34.31 
 
 		 781 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  34.08 
 
 		 614 aa  149  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 		 642 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 		 703 aa  149  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.78 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.63 
 
 		 664 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 		 862 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.98 
 
 		 635 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.71 
 
 		 603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.11 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  34.81 
 
 		 661 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  35.93 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 		 598 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  34.36 
 
 		 638 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 651 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 		 612 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 641 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.47 
 
 		 681 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.48 
 
 		 715 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 		 691 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  35.21 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  35.34 
 
 		 609 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.4 
 
 		 551 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.08 
 
 		 841 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.21 
 
 		 700 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 		 604 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  36.88 
 
 		 646 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.08 
 
 		 668 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2951  serine/threonine protein kinase-like protein  33.33 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0439076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 		 625 aa  143  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  36.09 
 
 		 1057 aa  143  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.56 
 
 		 641 aa  142  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 915 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 		 776 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 		 985 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 938 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.33 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  34.62 
 
 		 623 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 557 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  33.82 
 
 		 667 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 888 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  34.97 
 
 		 951 aa  141  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 		 632 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4009  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.82 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.8 
 
 		 896 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  34.96 
 
 		 625 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>