30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3961 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3374  NERD domain-containing protein  39.22 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000216973  decreased coverage  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3845  NERD domain-containing protein  38.31 
 
 		 329 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0647  NERD domain-containing protein  38.06 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016807  hitchhiker  0.00000125306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0648  NERD domain-containing protein  38.19 
 
 		 329 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0135957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0675  NERD domain-containing protein  37.86 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160777  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  35.93 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3685  NERD domain-containing protein  36.06 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0336  hypothetical protein  43.35 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1003  NERD domain-containing protein  25.64 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0218  NERD domain protein  31.95 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  24.69 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  23.55 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0665  HRDC domain-containing protein  26.43 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.126203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0664  HRDC domain-containing protein  26.43 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0121317  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  32.35 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  34.57 
 
 		 338 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  29.41 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  25 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  23.35 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  29.13 
 
 		 224 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  25.62 
 
 		 225 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  27.1 
 
 		 267 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  31.34 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  23.12 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  26.42 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  26.67 
 
 		 207 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  29.73 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  24.35 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>