274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0665 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0665  HRDC domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  711    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.126203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0664  HRDC domain-containing protein  97.23 
 
 		 361 aa  688    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0121317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0218  NERD domain protein  29.96 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  27.84 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 		 602 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5226  nerd domain protein  25.54 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0869154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.55 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.16 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1003  NERD domain-containing protein  24.35 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.49 
 
 		 619 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  34.18 
 
 		 682 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0019  nerd domain protein  25.54 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.580862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.66 
 
 		 617 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1535  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.49 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36 
 
 		 602 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.31 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.29 
 
 		 599 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5192  nerd domain protein  28.48 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.68 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.1 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.1 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.1 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  43.1 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  43.1 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.1 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.1 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.12 
 
 		 599 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.1 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.77 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.1 
 
 		 705 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.1 
 
 		 610 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.62 
 
 		 603 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 		 599 aa  57  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.11 
 
 		 748 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1066  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.23 
 
 		 681 aa  56.6  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.859317  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.62 
 
 		 625 aa  56.6  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.3 
 
 		 721 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 707 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4790  hypothetical protein  27.85 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0336  hypothetical protein  24.46 
 
 		 234 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 		 615 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 		 615 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 		 615 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.38 
 
 		 728 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.67 
 
 		 620 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.88 
 
 		 724 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5243  nerd domain protein  28.77 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 		 615 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 		 615 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.67 
 
 		 617 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 		 609 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 		 615 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  39.39 
 
 		 608 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  39.39 
 
 		 608 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  30.88 
 
 		 702 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.43 
 
 		 596 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.14 
 
 		 633 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.84 
 
 		 615 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.31 
 
 		 711 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.35 
 
 		 689 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3491  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.43 
 
 		 635 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.394167  normal  0.250752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3660  NERD domain-containing protein  26.73 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3685  NERD domain-containing protein  24.85 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 		 603 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.65 
 
 		 599 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.98 
 
 		 607 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 613 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 787 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.59 
 
 		 607 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.59 
 
 		 607 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.2 
 
 		 626 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.59 
 
 		 607 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.59 
 
 		 607 aa  53.5  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 		 611 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 		 607 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  32.84 
 
 		 697 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.67 
 
 		 624 aa  53.1  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 		 607 aa  53.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.38 
 
 		 615 aa  53.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.14 
 
 		 714 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.67 
 
 		 611 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.59 
 
 		 607 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.59 
 
 		 607 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.59 
 
 		 607 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  30.16 
 
 		 615 aa  53.1  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.71 
 
 		 630 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 		 608 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.59 
 
 		 607 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.73 
 
 		 731 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.87 
 
 		 597 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.87 
 
 		 610 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3105  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.1 
 
 		 613 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.34837  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 		 611 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 		 611 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.78 
 
 		 710 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.88 
 
 		 647 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3513  NERD domain-containing protein  25.83 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.87 
 
 		 614 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  34.92 
 
 		 726 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  32.84 
 
 		 876 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>