More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2965 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  57.02 
 
 		 707 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 682 aa  1352    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  57.87 
 
 		 694 aa  677    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  55.96 
 
 		 685 aa  648    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  56.41 
 
 		 697 aa  687    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  56.54 
 
 		 787 aa  751    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.54 
 
 		 710 aa  648    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  56.41 
 
 		 670 aa  647    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  65.35 
 
 		 712 aa  861    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  56.39 
 
 		 709 aa  720    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  54.31 
 
 		 759 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  57.96 
 
 		 736 aa  699    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  76.99 
 
 		 689 aa  995    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  57.89 
 
 		 685 aa  663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  58.5 
 
 		 719 aa  684    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  56.04 
 
 		 717 aa  736    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  53.8 
 
 		 717 aa  637    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  56.24 
 
 		 707 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  55.04 
 
 		 699 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  57.02 
 
 		 714 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  66.38 
 
 		 702 aa  844    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  63.28 
 
 		 708 aa  855    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  54.9 
 
 		 684 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  56.62 
 
 		 674 aa  675    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  57.56 
 
 		 701 aa  745    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  56.3 
 
 		 726 aa  735    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  54.47 
 
 		 700 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  59.07 
 
 		 719 aa  675    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  57.35 
 
 		 688 aa  702    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  57.02 
 
 		 707 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  56 
 
 		 710 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  54.12 
 
 		 704 aa  657    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  51.72 
 
 		 697 aa  656    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  47.7 
 
 		 690 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  60.05 
 
 		 876 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  45.95 
 
 		 643 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  47.7 
 
 		 508 aa  333  5e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  35.34 
 
 		 739 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.58 
 
 		 685 aa  286  9e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  42.74 
 
 		 515 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.18 
 
 		 689 aa  278  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  34.38 
 
 		 744 aa  278  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  31.13 
 
 		 714 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.27 
 
 		 689 aa  273  8.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  33.84 
 
 		 798 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.65 
 
 		 686 aa  265  3e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  33.39 
 
 		 800 aa  263  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  33.18 
 
 		 790 aa  256  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  33.64 
 
 		 795 aa  256  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  33.49 
 
 		 795 aa  256  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.06 
 
 		 785 aa  256  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  33.74 
 
 		 797 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.83 
 
 		 786 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  32.67 
 
 		 680 aa  253  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  34.4 
 
 		 816 aa  253  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.64 
 
 		 751 aa  252  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  32.47 
 
 		 688 aa  251  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.64 
 
 		 751 aa  250  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  31.36 
 
 		 668 aa  249  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  29.66 
 
 		 755 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  34.22 
 
 		 728 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.77 
 
 		 742 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  32.23 
 
 		 817 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  28.49 
 
 		 749 aa  246  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  32.28 
 
 		 620 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.27 
 
 		 711 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  31.98 
 
 		 746 aa  243  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  28.79 
 
 		 696 aa  242  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  32.1 
 
 		 807 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  29.98 
 
 		 722 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  29.98 
 
 		 722 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  29.83 
 
 		 722 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.62 
 
 		 663 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  30.05 
 
 		 735 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  31.88 
 
 		 825 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  28.39 
 
 		 706 aa  237  6e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  26.89 
 
 		 687 aa  236  7e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  31.78 
 
 		 735 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3367  UvrD/REP helicase  31.16 
 
 		 847 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561637 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  36.32 
 
 		 707 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  29.51 
 
 		 739 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  30.87 
 
 		 653 aa  234  6e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  33.6 
 
 		 736 aa  234  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  31.34 
 
 		 727 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  31.38 
 
 		 826 aa  233  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  31.15 
 
 		 816 aa  233  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 764 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  29.9 
 
 		 858 aa  232  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  34.17 
 
 		 1050 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.05 
 
 		 718 aa  232  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.44 
 
 		 768 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1369  DNA helicase II  29.75 
 
 		 858 aa  231  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.05 
 
 		 741 aa  231  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 		 741 aa  231  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2023  UvrD/REP helicase  30.57 
 
 		 845 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1764  UvrD/REP helicase  29.49 
 
 		 864 aa  230  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.29 
 
 		 876 aa  230  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  34.22 
 
 		 1032 aa  230  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.44 
 
 		 772 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  29.78 
 
 		 726 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>