More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1535 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1535  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
596 aa  1234    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297932  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.89 
 
 
591 aa  589  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.62 
 
 
617 aa  507  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.47 
 
 
610 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.47 
 
 
610 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.47 
 
 
597 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 
619 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.78 
 
 
674 aa  502  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  44.13 
 
 
615 aa  502  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.96 
 
 
599 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.62 
 
 
608 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.12 
 
 
607 aa  492  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.62 
 
 
608 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.78 
 
 
614 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.84 
 
 
615 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.01 
 
 
599 aa  488  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.32 
 
 
611 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.32 
 
 
609 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.49 
 
 
609 aa  478  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.32 
 
 
609 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.16 
 
 
599 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.32 
 
 
611 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  39.32 
 
 
611 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.32 
 
 
611 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.32 
 
 
609 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  39.32 
 
 
609 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.61 
 
 
596 aa  472  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.83 
 
 
615 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.34 
 
 
599 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 
615 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 
615 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.29 
 
 
602 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 
615 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 
615 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.4 
 
 
607 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.37 
 
 
607 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.77 
 
 
611 aa  467  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.05 
 
 
602 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
609 aa  468  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.55 
 
 
607 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.58 
 
 
607 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.71 
 
 
633 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.55 
 
 
607 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.37 
 
 
714 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.14 
 
 
601 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 
620 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
710 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  40.67 
 
 
709 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.93 
 
 
607 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.72 
 
 
629 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.72 
 
 
613 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.93 
 
 
607 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.55 
 
 
607 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.27 
 
 
607 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 
611 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.3 
 
 
610 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.93 
 
 
607 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.93 
 
 
607 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.71 
 
 
603 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 
709 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  42.11 
 
 
608 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  41.77 
 
 
608 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 
715 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 
709 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.93 
 
 
622 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.53 
 
 
709 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
707 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 
626 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.54 
 
 
709 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.9 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  42.35 
 
 
613 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.37 
 
 
624 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 
615 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
715 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 
618 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.59 
 
 
625 aa  452  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.9 
 
 
709 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.37 
 
 
609 aa  451  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.19 
 
 
731 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.86 
 
 
714 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.33 
 
 
608 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.46 
 
 
719 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 
615 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.77 
 
 
711 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 
715 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 
621 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.87 
 
 
712 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.8 
 
 
715 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.93 
 
 
607 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.22 
 
 
615 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.08 
 
 
600 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.4 
 
 
611 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.4 
 
 
611 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.79 
 
 
612 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 
601 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.17 
 
 
625 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 
607 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  40.27 
 
 
601 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 
625 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
717 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>