More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2576 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.33 
 
 		 608 aa  839    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  66.06 
 
 		 611 aa  846    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  66.22 
 
 		 611 aa  848    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.17 
 
 		 603 aa  709    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 620 aa  1297    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  67.01 
 
 		 610 aa  850    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  67.12 
 
 		 609 aa  835    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.56 
 
 		 615 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.22 
 
 		 615 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.88 
 
 		 607 aa  831    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 607 aa  744    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.78 
 
 		 715 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  67.01 
 
 		 610 aa  850    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  86.58 
 
 		 611 aa  1130    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.39 
 
 		 615 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.56 
 
 		 615 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.4 
 
 		 599 aa  714    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.89 
 
 		 596 aa  699    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.59 
 
 		 607 aa  748    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.95 
 
 		 601 aa  695    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  54.59 
 
 		 613 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.65 
 
 		 629 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.22 
 
 		 611 aa  847    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.59 
 
 		 607 aa  749    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.22 
 
 		 611 aa  848    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  53.55 
 
 		 601 aa  660    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.56 
 
 		 615 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  85.43 
 
 		 625 aa  1116    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.14 
 
 		 607 aa  732    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.55 
 
 		 614 aa  845    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.59 
 
 		 607 aa  748    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.33 
 
 		 608 aa  839    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.29 
 
 		 613 aa  731    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  67.01 
 
 		 597 aa  849    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.22 
 
 		 609 aa  847    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.41 
 
 		 610 aa  744    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.59 
 
 		 607 aa  749    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.56 
 
 		 615 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.91 
 
 		 602 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.06 
 
 		 609 aa  845    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.24 
 
 		 607 aa  751    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.97 
 
 		 607 aa  722    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.02 
 
 		 624 aa  770    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.21 
 
 		 601 aa  655    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.32 
 
 		 607 aa  748    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.25 
 
 		 607 aa  744    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.96 
 
 		 615 aa  736    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.38 
 
 		 608 aa  728    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.57 
 
 		 599 aa  702    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.22 
 
 		 609 aa  848    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.22 
 
 		 609 aa  848    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  77.09 
 
 		 611 aa  1025    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.15 
 
 		 607 aa  745    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.27 
 
 		 714 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.95 
 
 		 599 aa  848    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.14 
 
 		 607 aa  727    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  66.06 
 
 		 609 aa  847    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.23 
 
 		 602 aa  758    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  49.25 
 
 		 608 aa  612  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  49.34 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.83 
 
 		 625 aa  589  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.84 
 
 		 719 aa  588  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.33 
 
 		 607 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.83 
 
 		 611 aa  585  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.56 
 
 		 626 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.57 
 
 		 712 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.32 
 
 		 711 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.42 
 
 		 711 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.04 
 
 		 709 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.76 
 
 		 633 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.14 
 
 		 710 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49 
 
 		 633 aa  575  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.39 
 
 		 707 aa  575  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.6 
 
 		 609 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.24 
 
 		 715 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.72 
 
 		 601 aa  568  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.02 
 
 		 622 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.66 
 
 		 714 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.22 
 
 		 715 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.22 
 
 		 715 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  46.53 
 
 		 709 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.36 
 
 		 709 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.36 
 
 		 621 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.97 
 
 		 617 aa  558  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.24 
 
 		 603 aa  557  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.42 
 
 		 600 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.23 
 
 		 598 aa  552  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.57 
 
 		 748 aa  552  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.95 
 
 		 681 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.59 
 
 		 605 aa  552  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.33 
 
 		 657 aa  551  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.83 
 
 		 679 aa  549  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.89 
 
 		 647 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.89 
 
 		 615 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.92 
 
 		 685 aa  547  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.05 
 
 		 633 aa  547  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.01 
 
 		 599 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.89 
 
 		 763 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46 
 
 		 600 aa  547  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.89 
 
 		 658 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>