More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0218 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.13 
 
 
601 aa  677    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  80.82 
 
 
611 aa  1035    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  80.98 
 
 
611 aa  1036    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.29 
 
 
603 aa  678    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  89.67 
 
 
614 aa  1132    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
610 aa  1256    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
610 aa  1256    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.46 
 
 
599 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.45 
 
 
615 aa  656    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.11 
 
 
607 aa  738    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  67.01 
 
 
620 aa  850    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  81.15 
 
 
609 aa  1036    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  80.98 
 
 
609 aa  1036    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  81.15 
 
 
609 aa  1039    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.48 
 
 
608 aa  727    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.35 
 
 
596 aa  678    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.82 
 
 
615 aa  1035    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  83.91 
 
 
607 aa  1070    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.72 
 
 
601 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.95 
 
 
715 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  83.5 
 
 
599 aa  1052    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  64.48 
 
 
625 aa  823    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.66 
 
 
615 aa  1033    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.25 
 
 
607 aa  738    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.22 
 
 
610 aa  729    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.98 
 
 
611 aa  1035    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.25 
 
 
607 aa  739    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.82 
 
 
615 aa  1034    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.04 
 
 
613 aa  732    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  86.07 
 
 
608 aa  1093    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.44 
 
 
599 aa  694    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  85.9 
 
 
608 aa  1093    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.15 
 
 
611 aa  835    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  81.15 
 
 
609 aa  1039    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  54.73 
 
 
613 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.2 
 
 
602 aa  662    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  54.96 
 
 
601 aa  676    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.98 
 
 
611 aa  1036    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.82 
 
 
609 aa  1033    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.59 
 
 
607 aa  739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.41 
 
 
607 aa  728    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  79.84 
 
 
609 aa  1028    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  63.07 
 
 
624 aa  790    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.73 
 
 
607 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.73 
 
 
607 aa  737    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.25 
 
 
615 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.82 
 
 
615 aa  1034    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.25 
 
 
607 aa  739    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  99.83 
 
 
597 aa  1228    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.82 
 
 
615 aa  1034    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.08 
 
 
611 aa  827    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.73 
 
 
607 aa  736    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54 
 
 
714 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.81 
 
 
607 aa  744    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.09 
 
 
607 aa  734    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.88 
 
 
602 aa  751    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.25 
 
 
607 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.51 
 
 
629 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  51.1 
 
 
608 aa  611  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  50.93 
 
 
608 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.64 
 
 
711 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 
719 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48 
 
 
714 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.42 
 
 
715 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.58 
 
 
715 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.82 
 
 
607 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.58 
 
 
599 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.25 
 
 
715 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.07 
 
 
711 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.73 
 
 
710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.82 
 
 
712 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.57 
 
 
609 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.81 
 
 
709 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.26 
 
 
626 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.32 
 
 
611 aa  561  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.36 
 
 
625 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  47.48 
 
 
709 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.24 
 
 
598 aa  557  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.74 
 
 
603 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.32 
 
 
600 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.55 
 
 
709 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.57 
 
 
617 aa  555  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.61 
 
 
717 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.79 
 
 
622 aa  555  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.62 
 
 
621 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.75 
 
 
657 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.98 
 
 
601 aa  554  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.04 
 
 
633 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.88 
 
 
707 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.8 
 
 
600 aa  547  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  47.8 
 
 
600 aa  545  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.53 
 
 
647 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.82 
 
 
709 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.55 
 
 
598 aa  546  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.72 
 
 
763 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.67 
 
 
625 aa  545  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.72 
 
 
615 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.72 
 
 
647 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.88 
 
 
709 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.48 
 
 
705 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>