More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03701 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.82 
 
 
610 aa  1035    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 
611 aa  1269    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  99.67 
 
 
611 aa  1267    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.87 
 
 
603 aa  683    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  64.97 
 
 
625 aa  823    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.5 
 
 
607 aa  739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.39 
 
 
615 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.33 
 
 
607 aa  737    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.46 
 
 
607 aa  738    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.74 
 
 
715 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  94.6 
 
 
615 aa  1209    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.97 
 
 
599 aa  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  78.85 
 
 
614 aa  1019    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  94.93 
 
 
615 aa  1213    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  94.6 
 
 
615 aa  1209    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.66 
 
 
596 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.28 
 
 
610 aa  717    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  54.15 
 
 
613 aa  650    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.44 
 
 
601 aa  680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  99.51 
 
 
611 aa  1265    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  90.48 
 
 
609 aa  1166    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.01 
 
 
607 aa  720    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  54.62 
 
 
601 aa  663    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.15 
 
 
608 aa  711    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.43 
 
 
608 aa  1040    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.33 
 
 
607 aa  736    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.45 
 
 
601 aa  662    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  77.92 
 
 
607 aa  1012    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  78.89 
 
 
599 aa  1003    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  99.84 
 
 
609 aa  1263    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.76 
 
 
608 aa  1042    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  99.51 
 
 
609 aa  1261    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.56 
 
 
613 aa  720    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  99.67 
 
 
611 aa  1267    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  63.59 
 
 
611 aa  818    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  94.76 
 
 
615 aa  1211    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.82 
 
 
610 aa  1035    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  94.44 
 
 
615 aa  1206    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.91 
 
 
602 aa  662    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  99.51 
 
 
609 aa  1261    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  81.88 
 
 
597 aa  1028    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  99.18 
 
 
609 aa  1256    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.08 
 
 
607 aa  711    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.33 
 
 
607 aa  738    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.01 
 
 
624 aa  764    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  64.97 
 
 
611 aa  830    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.16 
 
 
607 aa  737    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.16 
 
 
607 aa  737    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.13 
 
 
599 aa  651    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.97 
 
 
615 aa  715    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.33 
 
 
607 aa  737    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  66.06 
 
 
620 aa  846    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.16 
 
 
607 aa  736    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.35 
 
 
714 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  99.34 
 
 
609 aa  1258    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.75 
 
 
607 aa  731    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.39 
 
 
602 aa  741    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.96 
 
 
629 aa  617  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.83 
 
 
711 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  49 
 
 
608 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  48.83 
 
 
608 aa  582  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.9 
 
 
707 aa  578  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.19 
 
 
715 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.83 
 
 
719 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.25 
 
 
715 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.19 
 
 
715 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.99 
 
 
714 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.67 
 
 
609 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.15 
 
 
709 aa  568  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48 
 
 
710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.42 
 
 
626 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.73 
 
 
607 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.93 
 
 
717 aa  555  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.15 
 
 
707 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.83 
 
 
611 aa  557  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.66 
 
 
712 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.07 
 
 
711 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.16 
 
 
625 aa  558  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.68 
 
 
709 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.53 
 
 
633 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  46.84 
 
 
709 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.32 
 
 
617 aa  549  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.47 
 
 
622 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.47 
 
 
598 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.8 
 
 
603 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.17 
 
 
647 aa  550  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.92 
 
 
630 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.04 
 
 
621 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 
709 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.72 
 
 
790 aa  551  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.19 
 
 
739 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.24 
 
 
709 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.23 
 
 
705 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.41 
 
 
709 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.74 
 
 
625 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.62 
 
 
657 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.3 
 
 
718 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.83 
 
 
685 aa  539  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.93 
 
 
616 aa  541  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.63 
 
 
615 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>