More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1427 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.27 
 
 		 718 aa  978    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 709 aa  1470    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.94 
 
 		 731 aa  879    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  76.41 
 
 		 709 aa  1160    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  63.19 
 
 		 722 aa  947    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  76.55 
 
 		 709 aa  1163    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.41 
 
 		 715 aa  618  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.41 
 
 		 881 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.92 
 
 		 714 aa  592  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.56 
 
 		 717 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.13 
 
 		 647 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.48 
 
 		 711 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.12 
 
 		 601 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  47.64 
 
 		 611 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.64 
 
 		 611 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 611 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 611 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.11 
 
 		 612 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  47.64 
 
 		 609 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 609 aa  549  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.33 
 
 		 707 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 609 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.96 
 
 		 602 aa  549  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.48 
 
 		 719 aa  548  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 609 aa  548  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.82 
 
 		 597 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.49 
 
 		 601 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.82 
 
 		 610 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.82 
 
 		 599 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 609 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.82 
 
 		 610 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.8 
 
 		 625 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.9 
 
 		 608 aa  545  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.39 
 
 		 603 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  48.33 
 
 		 601 aa  544  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 		 748 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.73 
 
 		 608 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.92 
 
 		 707 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.23 
 
 		 615 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.06 
 
 		 615 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  44.87 
 
 		 608 aa  537  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.04 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.06 
 
 		 606 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.89 
 
 		 615 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.05 
 
 		 598 aa  536  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.39 
 
 		 609 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.06 
 
 		 615 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.89 
 
 		 615 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.98 
 
 		 599 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  44.56 
 
 		 608 aa  532  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.11 
 
 		 605 aa  535  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.73 
 
 		 601 aa  532  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.11 
 
 		 615 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.46 
 
 		 611 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.89 
 
 		 599 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.21 
 
 		 614 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.19 
 
 		 596 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.46 
 
 		 620 aa  525  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.96 
 
 		 625 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.02 
 
 		 611 aa  525  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.02 
 
 		 611 aa  525  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.2 
 
 		 602 aa  522  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  45.65 
 
 		 600 aa  519  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.48 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.67 
 
 		 611 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.32 
 
 		 617 aa  521  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.51 
 
 		 615 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.15 
 
 		 600 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.12 
 
 		 724 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.14 
 
 		 705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.93 
 
 		 721 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.86 
 
 		 624 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.89 
 
 		 714 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.06 
 
 		 619 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.74 
 
 		 607 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.87 
 
 		 612 aa  512  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  42.01 
 
 		 709 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.59 
 
 		 615 aa  513  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.1 
 
 		 711 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.69 
 
 		 739 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.65 
 
 		 629 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.55 
 
 		 712 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.86 
 
 		 709 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.87 
 
 		 674 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.19 
 
 		 709 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.89 
 
 		 611 aa  512  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.85 
 
 		 715 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.3 
 
 		 626 aa  505  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 		 707 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.18 
 
 		 728 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.87 
 
 		 626 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.26 
 
 		 607 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.33 
 
 		 607 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.94 
 
 		 603 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.46 
 
 		 710 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.11 
 
 		 607 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.7 
 
 		 715 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.5 
 
 		 607 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.7 
 
 		 715 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  44.59 
 
 		 613 aa  508  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>